Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gjb3P28231 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gjb3P28231 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gjb3P28231 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gjb3P28231 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gjb3P28231 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gjb3P28231 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Gjb3P28231 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gjb3P28231 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gjb3P28231 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Gjb3P28231 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Gjb3P28231 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gjb3P28231 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gjb3P28231 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gjb3P28231 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gjb3P28231 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gjb3P28231 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gjb3P28231 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gjb3P28231 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gjb3P28231 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gjb3P28231 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Gjb3P28231 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gjb3P28231 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gjb3P28231 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Gjb3P28231 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Gjb3P28231 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gjb3P28231 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gjb3P28231 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gjb3P28231 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gjb3P28231 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gjb3P28231 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gjb3P28231 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gjb3P28231 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gjb3P28231 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gjb3P28231 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gjb3P28231 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gjb3P28231 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gjb3P28231 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gjb3P28231 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gjb3P28231 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gjb3P28231 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gjb3P28231 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gjb3P28231 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gjb3P28231 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gjb3P28231 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gjb3P28231 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gjb3P28231 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gjb3P28231 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gjb3P28231 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Gjb3P28231 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Gjb3P28231 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gjb3P28231 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gjb3P28231 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gjb3P28231 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gjb3P28231 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Gjb3P28231 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gjb3P28231 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gjb3P28231 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gjb3P28231 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gjb3P28231 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gjb3P28231 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gjb3P28231 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gjb3P28231 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gjb3P28231 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gjb3P28231 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gjb3P28231 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gjb3P28231 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gjb3P28231 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gjb3P28231 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gjb3P28231 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gjb3P28231 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gjb3P28231 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gjb3P28231 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Gjb3P28231 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gjb3P28231 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gjb3P28231 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gjb3P28231 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gjb3P28231 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gjb3P28231 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gjb3P28231 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Gjb3P28231 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gjb3P28231 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gjb3P28231 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gjb3P28231 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gjb3P28231 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gjb3P28231 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gjb3P28231 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gjb3P28231 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gjb3P28231 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gjb3P28231 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gjb3P28231 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gjb3P28231 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gjb3P28231 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gjb3P28231 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gjb3P28231 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Gjb3P28231 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gjb3P28231 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gjb3P28231 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gjb3P28231 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Gjb3P28231 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms