Protein–RNA interactions for Protein: P27782

Lef1, Lymphoid enhancer-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lef1P27782 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lef1P27782 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lef1P27782 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lef1P27782 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lef1P27782 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lef1P27782 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lef1P27782 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lef1P27782 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lef1P27782 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lef1P27782 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lef1P27782 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lef1P27782 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lef1P27782 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Lef1P27782 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lef1P27782 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lef1P27782 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lef1P27782 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lef1P27782 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lef1P27782 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Lef1P27782 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lef1P27782 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lef1P27782 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lef1P27782 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lef1P27782 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lef1P27782 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lef1P27782 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lef1P27782 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lef1P27782 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lef1P27782 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lef1P27782 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lef1P27782 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lef1P27782 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lef1P27782 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lef1P27782 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lef1P27782 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lef1P27782 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lef1P27782 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Lef1P27782 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lef1P27782 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lef1P27782 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lef1P27782 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lef1P27782 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Lef1P27782 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lef1P27782 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lef1P27782 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lef1P27782 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lef1P27782 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Lef1P27782 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lef1P27782 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lef1P27782 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lef1P27782 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lef1P27782 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lef1P27782 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lef1P27782 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lef1P27782 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lef1P27782 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lef1P27782 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lef1P27782 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lef1P27782 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lef1P27782 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lef1P27782 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lef1P27782 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lef1P27782 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lef1P27782 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lef1P27782 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lef1P27782 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lef1P27782 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lef1P27782 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lef1P27782 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lef1P27782 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lef1P27782 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lef1P27782 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lef1P27782 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lef1P27782 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lef1P27782 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lef1P27782 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lef1P27782 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lef1P27782 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lef1P27782 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lef1P27782 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lef1P27782 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lef1P27782 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lef1P27782 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lef1P27782 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lef1P27782 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lef1P27782 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lef1P27782 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lef1P27782 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lef1P27782 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lef1P27782 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lef1P27782 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lef1P27782 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lef1P27782 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lef1P27782 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lef1P27782 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lef1P27782 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lef1P27782 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lef1P27782 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lef1P27782 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lef1P27782 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms