Protein–RNA interactions for Protein: P26516

Psmd7, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd7P26516 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmd7P26516 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psmd7P26516 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psmd7P26516 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psmd7P26516 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psmd7P26516 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psmd7P26516 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psmd7P26516 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psmd7P26516 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmd7P26516 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmd7P26516 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmd7P26516 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmd7P26516 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Psmd7P26516 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmd7P26516 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmd7P26516 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmd7P26516 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmd7P26516 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmd7P26516 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psmd7P26516 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmd7P26516 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmd7P26516 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmd7P26516 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmd7P26516 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmd7P26516 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmd7P26516 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmd7P26516 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmd7P26516 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmd7P26516 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmd7P26516 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmd7P26516 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmd7P26516 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmd7P26516 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmd7P26516 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmd7P26516 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmd7P26516 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmd7P26516 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmd7P26516 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psmd7P26516 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psmd7P26516 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psmd7P26516 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psmd7P26516 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psmd7P26516 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmd7P26516 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmd7P26516 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Psmd7P26516 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmd7P26516 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmd7P26516 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psmd7P26516 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Psmd7P26516 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psmd7P26516 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psmd7P26516 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psmd7P26516 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psmd7P26516 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psmd7P26516 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psmd7P26516 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psmd7P26516 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Psmd7P26516 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psmd7P26516 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psmd7P26516 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psmd7P26516 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psmd7P26516 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psmd7P26516 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psmd7P26516 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psmd7P26516 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psmd7P26516 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmd7P26516 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmd7P26516 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmd7P26516 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmd7P26516 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmd7P26516 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Psmd7P26516 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psmd7P26516 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psmd7P26516 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psmd7P26516 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmd7P26516 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmd7P26516 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmd7P26516 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psmd7P26516 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psmd7P26516 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psmd7P26516 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psmd7P26516 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psmd7P26516 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psmd7P26516 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psmd7P26516 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmd7P26516 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psmd7P26516 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Psmd7P26516 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Psmd7P26516 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Psmd7P26516 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Psmd7P26516 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Psmd7P26516 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmd7P26516 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psmd7P26516 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psmd7P26516 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psmd7P26516 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psmd7P26516 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psmd7P26516 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psmd7P26516 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmd7P26516 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms