Protein–RNA interactions for Protein: P26350

Ptma, Prothymosin alpha, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtmaP26350 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PtmaP26350 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PtmaP26350 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PtmaP26350 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PtmaP26350 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PtmaP26350 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PtmaP26350 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PtmaP26350 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PtmaP26350 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PtmaP26350 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PtmaP26350 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PtmaP26350 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PtmaP26350 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PtmaP26350 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PtmaP26350 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PtmaP26350 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PtmaP26350 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PtmaP26350 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PtmaP26350 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PtmaP26350 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PtmaP26350 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PtmaP26350 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PtmaP26350 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PtmaP26350 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PtmaP26350 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PtmaP26350 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PtmaP26350 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
PtmaP26350 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PtmaP26350 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PtmaP26350 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PtmaP26350 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PtmaP26350 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PtmaP26350 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PtmaP26350 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PtmaP26350 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PtmaP26350 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PtmaP26350 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PtmaP26350 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PtmaP26350 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PtmaP26350 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PtmaP26350 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PtmaP26350 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PtmaP26350 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PtmaP26350 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PtmaP26350 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PtmaP26350 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PtmaP26350 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PtmaP26350 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PtmaP26350 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PtmaP26350 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PtmaP26350 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PtmaP26350 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PtmaP26350 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PtmaP26350 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PtmaP26350 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PtmaP26350 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PtmaP26350 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PtmaP26350 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PtmaP26350 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PtmaP26350 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PtmaP26350 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PtmaP26350 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PtmaP26350 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PtmaP26350 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PtmaP26350 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PtmaP26350 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PtmaP26350 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PtmaP26350 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PtmaP26350 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PtmaP26350 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PtmaP26350 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PtmaP26350 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PtmaP26350 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PtmaP26350 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PtmaP26350 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PtmaP26350 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PtmaP26350 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PtmaP26350 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PtmaP26350 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PtmaP26350 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PtmaP26350 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PtmaP26350 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PtmaP26350 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PtmaP26350 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PtmaP26350 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PtmaP26350 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PtmaP26350 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PtmaP26350 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PtmaP26350 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PtmaP26350 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PtmaP26350 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PtmaP26350 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PtmaP26350 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PtmaP26350 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PtmaP26350 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PtmaP26350 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PtmaP26350 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PtmaP26350 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PtmaP26350 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PtmaP26350 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms