Protein–RNA interactions for Protein: P26043

Rdx, Radixin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RdxP26043 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RdxP26043 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RdxP26043 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
RdxP26043 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RdxP26043 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
RdxP26043 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RdxP26043 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RdxP26043 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RdxP26043 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RdxP26043 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RdxP26043 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RdxP26043 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RdxP26043 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RdxP26043 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RdxP26043 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RdxP26043 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RdxP26043 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RdxP26043 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RdxP26043 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RdxP26043 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RdxP26043 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RdxP26043 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RdxP26043 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
RdxP26043 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RdxP26043 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RdxP26043 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RdxP26043 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RdxP26043 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RdxP26043 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RdxP26043 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RdxP26043 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RdxP26043 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RdxP26043 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RdxP26043 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RdxP26043 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RdxP26043 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RdxP26043 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RdxP26043 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RdxP26043 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RdxP26043 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RdxP26043 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RdxP26043 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RdxP26043 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RdxP26043 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RdxP26043 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RdxP26043 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RdxP26043 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RdxP26043 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RdxP26043 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RdxP26043 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RdxP26043 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RdxP26043 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RdxP26043 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RdxP26043 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RdxP26043 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RdxP26043 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RdxP26043 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RdxP26043 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RdxP26043 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RdxP26043 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RdxP26043 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RdxP26043 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RdxP26043 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RdxP26043 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RdxP26043 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
RdxP26043 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RdxP26043 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RdxP26043 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RdxP26043 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RdxP26043 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RdxP26043 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RdxP26043 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
RdxP26043 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
RdxP26043 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RdxP26043 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RdxP26043 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RdxP26043 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RdxP26043 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
RdxP26043 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RdxP26043 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RdxP26043 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RdxP26043 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RdxP26043 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RdxP26043 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RdxP26043 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RdxP26043 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RdxP26043 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RdxP26043 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RdxP26043 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RdxP26043 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RdxP26043 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RdxP26043 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RdxP26043 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RdxP26043 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RdxP26043 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RdxP26043 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RdxP26043 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RdxP26043 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RdxP26043 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RdxP26043 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms