Protein–RNA interactions for Protein: P25119

Tnfrsf1b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf1bP25119 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnfrsf1bP25119 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tnfrsf1bP25119 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnfrsf1bP25119 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnfrsf1bP25119 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnfrsf1bP25119 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnfrsf1bP25119 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnfrsf1bP25119 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnfrsf1bP25119 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnfrsf1bP25119 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnfrsf1bP25119 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnfrsf1bP25119 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnfrsf1bP25119 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnfrsf1bP25119 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnfrsf1bP25119 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnfrsf1bP25119 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnfrsf1bP25119 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnfrsf1bP25119 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnfrsf1bP25119 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnfrsf1bP25119 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnfrsf1bP25119 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnfrsf1bP25119 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnfrsf1bP25119 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnfrsf1bP25119 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnfrsf1bP25119 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnfrsf1bP25119 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnfrsf1bP25119 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnfrsf1bP25119 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnfrsf1bP25119 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnfrsf1bP25119 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnfrsf1bP25119 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnfrsf1bP25119 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnfrsf1bP25119 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnfrsf1bP25119 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnfrsf1bP25119 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnfrsf1bP25119 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnfrsf1bP25119 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnfrsf1bP25119 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnfrsf1bP25119 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnfrsf1bP25119 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnfrsf1bP25119 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnfrsf1bP25119 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnfrsf1bP25119 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnfrsf1bP25119 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnfrsf1bP25119 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnfrsf1bP25119 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnfrsf1bP25119 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnfrsf1bP25119 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnfrsf1bP25119 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnfrsf1bP25119 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnfrsf1bP25119 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnfrsf1bP25119 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnfrsf1bP25119 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnfrsf1bP25119 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnfrsf1bP25119 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnfrsf1bP25119 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnfrsf1bP25119 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnfrsf1bP25119 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnfrsf1bP25119 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnfrsf1bP25119 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnfrsf1bP25119 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnfrsf1bP25119 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnfrsf1bP25119 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnfrsf1bP25119 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnfrsf1bP25119 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnfrsf1bP25119 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnfrsf1bP25119 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnfrsf1bP25119 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnfrsf1bP25119 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnfrsf1bP25119 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnfrsf1bP25119 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnfrsf1bP25119 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnfrsf1bP25119 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnfrsf1bP25119 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnfrsf1bP25119 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnfrsf1bP25119 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnfrsf1bP25119 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnfrsf1bP25119 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnfrsf1bP25119 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnfrsf1bP25119 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnfrsf1bP25119 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tnfrsf1bP25119 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnfrsf1bP25119 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnfrsf1bP25119 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnfrsf1bP25119 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnfrsf1bP25119 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnfrsf1bP25119 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnfrsf1bP25119 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnfrsf1bP25119 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnfrsf1bP25119 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnfrsf1bP25119 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnfrsf1bP25119 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnfrsf1bP25119 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnfrsf1bP25119 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnfrsf1bP25119 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tnfrsf1bP25119 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tnfrsf1bP25119 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnfrsf1bP25119 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnfrsf1bP25119 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnfrsf1bP25119 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms