Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RarbP22605 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RarbP22605 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RarbP22605 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RarbP22605 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RarbP22605 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RarbP22605 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RarbP22605 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RarbP22605 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RarbP22605 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RarbP22605 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RarbP22605 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RarbP22605 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RarbP22605 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RarbP22605 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RarbP22605 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RarbP22605 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RarbP22605 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
RarbP22605 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RarbP22605 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RarbP22605 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RarbP22605 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
RarbP22605 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RarbP22605 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RarbP22605 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RarbP22605 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RarbP22605 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
RarbP22605 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RarbP22605 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RarbP22605 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RarbP22605 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
RarbP22605 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RarbP22605 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RarbP22605 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RarbP22605 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RarbP22605 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RarbP22605 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RarbP22605 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RarbP22605 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RarbP22605 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RarbP22605 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RarbP22605 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RarbP22605 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RarbP22605 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RarbP22605 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RarbP22605 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RarbP22605 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RarbP22605 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RarbP22605 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RarbP22605 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RarbP22605 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RarbP22605 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RarbP22605 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RarbP22605 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RarbP22605 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RarbP22605 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RarbP22605 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RarbP22605 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RarbP22605 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RarbP22605 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RarbP22605 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RarbP22605 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RarbP22605 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RarbP22605 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RarbP22605 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RarbP22605 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RarbP22605 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RarbP22605 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RarbP22605 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RarbP22605 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RarbP22605 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RarbP22605 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RarbP22605 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RarbP22605 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RarbP22605 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RarbP22605 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RarbP22605 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RarbP22605 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RarbP22605 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RarbP22605 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
RarbP22605 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RarbP22605 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RarbP22605 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RarbP22605 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RarbP22605 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RarbP22605 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RarbP22605 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RarbP22605 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RarbP22605 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RarbP22605 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RarbP22605 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RarbP22605 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RarbP22605 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RarbP22605 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RarbP22605 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RarbP22605 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RarbP22605 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RarbP22605 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RarbP22605 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RarbP22605 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms