Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clk1P22518 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clk1P22518 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clk1P22518 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clk1P22518 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clk1P22518 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clk1P22518 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clk1P22518 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clk1P22518 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clk1P22518 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Clk1P22518 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clk1P22518 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clk1P22518 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clk1P22518 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clk1P22518 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clk1P22518 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clk1P22518 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clk1P22518 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Clk1P22518 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clk1P22518 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clk1P22518 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clk1P22518 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clk1P22518 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clk1P22518 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clk1P22518 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clk1P22518 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Clk1P22518 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clk1P22518 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clk1P22518 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clk1P22518 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clk1P22518 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clk1P22518 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clk1P22518 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clk1P22518 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clk1P22518 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clk1P22518 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clk1P22518 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clk1P22518 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clk1P22518 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clk1P22518 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clk1P22518 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clk1P22518 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Clk1P22518 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Clk1P22518 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clk1P22518 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clk1P22518 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clk1P22518 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clk1P22518 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clk1P22518 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clk1P22518 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clk1P22518 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clk1P22518 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clk1P22518 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clk1P22518 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clk1P22518 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clk1P22518 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clk1P22518 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clk1P22518 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clk1P22518 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clk1P22518 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clk1P22518 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clk1P22518 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clk1P22518 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Clk1P22518 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clk1P22518 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Clk1P22518 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clk1P22518 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clk1P22518 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clk1P22518 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clk1P22518 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clk1P22518 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clk1P22518 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clk1P22518 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clk1P22518 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clk1P22518 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Clk1P22518 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clk1P22518 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clk1P22518 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clk1P22518 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clk1P22518 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clk1P22518 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clk1P22518 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clk1P22518 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clk1P22518 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clk1P22518 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Clk1P22518 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clk1P22518 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clk1P22518 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clk1P22518 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clk1P22518 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clk1P22518 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clk1P22518 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clk1P22518 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clk1P22518 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clk1P22518 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clk1P22518 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Clk1P22518 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clk1P22518 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clk1P22518 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clk1P22518 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms