Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tap1P21958 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tap1P21958 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tap1P21958 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tap1P21958 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tap1P21958 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tap1P21958 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Tap1P21958 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tap1P21958 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tap1P21958 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tap1P21958 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tap1P21958 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tap1P21958 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tap1P21958 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Tap1P21958 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tap1P21958 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tap1P21958 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tap1P21958 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tap1P21958 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tap1P21958 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tap1P21958 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tap1P21958 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tap1P21958 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tap1P21958 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tap1P21958 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tap1P21958 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Tap1P21958 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tap1P21958 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tap1P21958 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tap1P21958 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tap1P21958 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tap1P21958 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Tap1P21958 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Tap1P21958 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tap1P21958 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tap1P21958 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tap1P21958 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tap1P21958 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tap1P21958 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tap1P21958 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Tap1P21958 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tap1P21958 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Tap1P21958 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tap1P21958 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tap1P21958 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tap1P21958 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tap1P21958 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tap1P21958 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tap1P21958 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tap1P21958 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tap1P21958 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tap1P21958 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tap1P21958 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tap1P21958 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tap1P21958 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tap1P21958 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tap1P21958 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tap1P21958 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tap1P21958 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tap1P21958 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tap1P21958 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tap1P21958 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Tap1P21958 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Tap1P21958 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tap1P21958 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tap1P21958 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tap1P21958 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Tap1P21958 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tap1P21958 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tap1P21958 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tap1P21958 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tap1P21958 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tap1P21958 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tap1P21958 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tap1P21958 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tap1P21958 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tap1P21958 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tap1P21958 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tap1P21958 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tap1P21958 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Tap1P21958 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tap1P21958 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tap1P21958 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tap1P21958 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tap1P21958 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tap1P21958 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tap1P21958 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tap1P21958 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tap1P21958 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tap1P21958 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tap1P21958 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tap1P21958 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tap1P21958 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tap1P21958 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tap1P21958 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tap1P21958 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tap1P21958 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tap1P21958 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tap1P21958 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tap1P21958 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms