Protein–RNA interactions for Protein: P21275

Bmp4, Bone morphogenetic protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmp4P21275 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bmp4P21275 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Bmp4P21275 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Bmp4P21275 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Bmp4P21275 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Bmp4P21275 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Bmp4P21275 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bmp4P21275 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Bmp4P21275 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Bmp4P21275 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Bmp4P21275 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Bmp4P21275 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bmp4P21275 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bmp4P21275 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bmp4P21275 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bmp4P21275 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bmp4P21275 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bmp4P21275 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bmp4P21275 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bmp4P21275 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bmp4P21275 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Bmp4P21275 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Bmp4P21275 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Bmp4P21275 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bmp4P21275 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Bmp4P21275 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Bmp4P21275 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bmp4P21275 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bmp4P21275 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Bmp4P21275 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Bmp4P21275 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Bmp4P21275 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bmp4P21275 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bmp4P21275 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bmp4P21275 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Bmp4P21275 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Bmp4P21275 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Bmp4P21275 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bmp4P21275 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bmp4P21275 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bmp4P21275 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bmp4P21275 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bmp4P21275 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bmp4P21275 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bmp4P21275 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bmp4P21275 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bmp4P21275 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bmp4P21275 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bmp4P21275 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bmp4P21275 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bmp4P21275 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bmp4P21275 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bmp4P21275 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bmp4P21275 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bmp4P21275 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bmp4P21275 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Bmp4P21275 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bmp4P21275 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bmp4P21275 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bmp4P21275 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bmp4P21275 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Bmp4P21275 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bmp4P21275 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Bmp4P21275 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Bmp4P21275 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Bmp4P21275 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bmp4P21275 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Bmp4P21275 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Bmp4P21275 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Bmp4P21275 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Bmp4P21275 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Bmp4P21275 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Bmp4P21275 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bmp4P21275 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bmp4P21275 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Bmp4P21275 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Bmp4P21275 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Bmp4P21275 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Bmp4P21275 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Bmp4P21275 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bmp4P21275 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bmp4P21275 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bmp4P21275 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bmp4P21275 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bmp4P21275 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bmp4P21275 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Bmp4P21275 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bmp4P21275 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Bmp4P21275 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bmp4P21275 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Bmp4P21275 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Bmp4P21275 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Bmp4P21275 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Bmp4P21275 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bmp4P21275 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bmp4P21275 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bmp4P21275 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Bmp4P21275 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Bmp4P21275 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Bmp4P21275 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms