Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Defa-rs1P17533 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Defa-rs1P17533 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Defa-rs1P17533 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Defa-rs1P17533 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Defa-rs1P17533 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Defa-rs1P17533 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Defa-rs1P17533 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Defa-rs1P17533 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Defa-rs1P17533 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Defa-rs1P17533 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Defa-rs1P17533 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Defa-rs1P17533 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Defa-rs1P17533 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Defa-rs1P17533 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Defa-rs1P17533 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Defa-rs1P17533 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Defa-rs1P17533 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Defa-rs1P17533 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Defa-rs1P17533 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Defa-rs1P17533 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Defa-rs1P17533 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Defa-rs1P17533 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Defa-rs1P17533 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Defa-rs1P17533 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Defa-rs1P17533 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Defa-rs1P17533 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Defa-rs1P17533 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Defa-rs1P17533 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Defa-rs1P17533 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Defa-rs1P17533 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Defa-rs1P17533 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Defa-rs1P17533 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Defa-rs1P17533 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Defa-rs1P17533 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Defa-rs1P17533 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Defa-rs1P17533 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Defa-rs1P17533 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Defa-rs1P17533 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Defa-rs1P17533 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Defa-rs1P17533 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Defa-rs1P17533 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Defa-rs1P17533 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Defa-rs1P17533 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Defa-rs1P17533 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Defa-rs1P17533 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Defa-rs1P17533 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Defa-rs1P17533 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Defa-rs1P17533 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Defa-rs1P17533 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Defa-rs1P17533 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Defa-rs1P17533 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Defa-rs1P17533 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Defa-rs1P17533 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Defa-rs1P17533 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Defa-rs1P17533 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Defa-rs1P17533 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Defa-rs1P17533 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Defa-rs1P17533 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Defa-rs1P17533 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Defa-rs1P17533 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Defa-rs1P17533 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Defa-rs1P17533 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Defa-rs1P17533 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Defa-rs1P17533 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Defa-rs1P17533 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Defa-rs1P17533 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Defa-rs1P17533 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Defa-rs1P17533 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Defa-rs1P17533 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Defa-rs1P17533 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Defa-rs1P17533 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Defa-rs1P17533 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Defa-rs1P17533 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Defa-rs1P17533 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Defa-rs1P17533 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Defa-rs1P17533 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Defa-rs1P17533 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Defa-rs1P17533 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Defa-rs1P17533 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Defa-rs1P17533 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Defa-rs1P17533 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Defa-rs1P17533 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Defa-rs1P17533 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Defa-rs1P17533 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Defa-rs1P17533 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Defa-rs1P17533 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Defa-rs1P17533 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Defa-rs1P17533 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Defa-rs1P17533 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Defa-rs1P17533 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Defa-rs1P17533 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Defa-rs1P17533 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Defa-rs1P17533 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Defa-rs1P17533 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Defa-rs1P17533 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Defa-rs1P17533 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Defa-rs1P17533 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Defa-rs1P17533 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Defa-rs1P17533 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms