Protein–RNA interactions for Protein: P16390

Kcna3, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna3P16390 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,41■■■□□ 2,78
Kcna3P16390 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,39■■■□□ 2,78
Kcna3P16390 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,38■■■□□ 2,77
Kcna3P16390 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,37■■■□□ 2,77
Kcna3P16390 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC32,37■■■□□ 2,77
Kcna3P16390 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32,36■■■□□ 2,77
Kcna3P16390 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC32,36■■■□□ 2,77
Kcna3P16390 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,3■■■□□ 2,76
Kcna3P16390 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC32,28■■■□□ 2,76
Kcna3P16390 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,28■■■□□ 2,76
Kcna3P16390 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC32,28■■■□□ 2,76
Kcna3P16390 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC32,28■■■□□ 2,76
Kcna3P16390 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,28■■■□□ 2,76
Kcna3P16390 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,27■■■□□ 2,76
Kcna3P16390 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,25■■■□□ 2,75
Kcna3P16390 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC32,25■■■□□ 2,75
Kcna3P16390 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,25■■■□□ 2,75
Kcna3P16390 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32,24■■■□□ 2,75
Kcna3P16390 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC32,24■■■□□ 2,75
Kcna3P16390 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC32,23■■■□□ 2,75
Kcna3P16390 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC32,22■■■□□ 2,75
Kcna3P16390 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,18■■■□□ 2,74
Kcna3P16390 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,17■■■□□ 2,74
Kcna3P16390 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,16■■■□□ 2,74
Kcna3P16390 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,16■■■□□ 2,74
Kcna3P16390 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32,15■■■□□ 2,74
Kcna3P16390 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC32,15■■■□□ 2,74
Kcna3P16390 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,14■■■□□ 2,74
Kcna3P16390 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,14■■■□□ 2,74
Kcna3P16390 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,14■■■□□ 2,74
Kcna3P16390 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,14■■■□□ 2,74
Kcna3P16390 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC32,11■■■□□ 2,73
Kcna3P16390 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,1■■■□□ 2,73
Kcna3P16390 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC32,1■■■□□ 2,73
Kcna3P16390 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32,08■■■□□ 2,73
Kcna3P16390 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC32,08■■■□□ 2,73
Kcna3P16390 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC32,06■■■□□ 2,72
Kcna3P16390 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC32,06■■■□□ 2,72
Kcna3P16390 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,05■■■□□ 2,72
Kcna3P16390 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,05■■■□□ 2,72
Kcna3P16390 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,04■■■□□ 2,72
Kcna3P16390 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,04■■■□□ 2,72
Kcna3P16390 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32,04■■■□□ 2,72
Kcna3P16390 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,02■■■□□ 2,72
Kcna3P16390 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,02■■■□□ 2,72
Kcna3P16390 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC32,02■■■□□ 2,72
Kcna3P16390 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,01■■■□□ 2,72
Kcna3P16390 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2,71
Kcna3P16390 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2,71
Kcna3P16390 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2,71
Kcna3P16390 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC31,99■■■□□ 2,71
Kcna3P16390 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC31,96■■■□□ 2,71
Kcna3P16390 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC31,96■■■□□ 2,71
Kcna3P16390 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,96■■■□□ 2,71
Kcna3P16390 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC31,92■■■□□ 2,7
Kcna3P16390 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC31,92■■■□□ 2,7
Kcna3P16390 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,86■■■□□ 2,69
Kcna3P16390 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC31,86■■■□□ 2,69
Kcna3P16390 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC31,86■■■□□ 2,69
Kcna3P16390 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,85■■■□□ 2,69
Kcna3P16390 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC31,85■■■□□ 2,69
Kcna3P16390 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC31,84■■■□□ 2,69
Kcna3P16390 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC31,83■■■□□ 2,69
Kcna3P16390 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,83■■■□□ 2,69
Kcna3P16390 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31,83■■■□□ 2,69
Kcna3P16390 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,82■■■□□ 2,68
Kcna3P16390 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,82■■■□□ 2,68
Kcna3P16390 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC31,82■■■□□ 2,68
Kcna3P16390 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,81■■■□□ 2,68
Kcna3P16390 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,8■■■□□ 2,68
Kcna3P16390 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC31,79■■■□□ 2,68
Kcna3P16390 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31,79■■■□□ 2,68
Kcna3P16390 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC31,78■■■□□ 2,68
Kcna3P16390 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,76■■■□□ 2,67
Kcna3P16390 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,75■■■□□ 2,67
Kcna3P16390 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,75■■■□□ 2,67
Kcna3P16390 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC31,75■■■□□ 2,67
Kcna3P16390 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC31,74■■■□□ 2,67
Kcna3P16390 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC31,72■■■□□ 2,67
Kcna3P16390 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,71■■■□□ 2,67
Kcna3P16390 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC31,71■■■□□ 2,67
Kcna3P16390 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC31,7■■■□□ 2,67
Kcna3P16390 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,7■■■□□ 2,67
Kcna3P16390 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,7■■■□□ 2,67
Kcna3P16390 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,7■■■□□ 2,67
Kcna3P16390 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,7■■■□□ 2,66
Kcna3P16390 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,7■■■□□ 2,66
Kcna3P16390 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC31,68■■■□□ 2,66
Kcna3P16390 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,68■■■□□ 2,66
Kcna3P16390 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC31,67■■■□□ 2,66
Kcna3P16390 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC31,67■■■□□ 2,66
Kcna3P16390 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC31,66■■■□□ 2,66
Kcna3P16390 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC31,66■■■□□ 2,66
Kcna3P16390 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,65■■■□□ 2,66
Kcna3P16390 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC31,64■■■□□ 2,66
Kcna3P16390 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC31,64■■■□□ 2,66
Kcna3P16390 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,63■■■□□ 2,65
Kcna3P16390 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,63■■■□□ 2,65
Kcna3P16390 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,62■■■□□ 2,65
Kcna3P16390 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,6■■■□□ 2,65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 239,2 ms