Protein–RNA interactions for Protein: P16014

Chgb, Secretogranin-1, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgbP16014 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ChgbP16014 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ChgbP16014 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ChgbP16014 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ChgbP16014 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ChgbP16014 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ChgbP16014 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ChgbP16014 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ChgbP16014 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ChgbP16014 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ChgbP16014 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ChgbP16014 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ChgbP16014 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ChgbP16014 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ChgbP16014 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ChgbP16014 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ChgbP16014 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ChgbP16014 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ChgbP16014 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ChgbP16014 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ChgbP16014 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ChgbP16014 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ChgbP16014 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ChgbP16014 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ChgbP16014 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ChgbP16014 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ChgbP16014 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ChgbP16014 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ChgbP16014 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ChgbP16014 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ChgbP16014 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ChgbP16014 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ChgbP16014 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ChgbP16014 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ChgbP16014 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ChgbP16014 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ChgbP16014 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ChgbP16014 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ChgbP16014 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ChgbP16014 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ChgbP16014 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ChgbP16014 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ChgbP16014 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ChgbP16014 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ChgbP16014 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ChgbP16014 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ChgbP16014 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ChgbP16014 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ChgbP16014 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ChgbP16014 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ChgbP16014 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ChgbP16014 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ChgbP16014 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ChgbP16014 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ChgbP16014 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ChgbP16014 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ChgbP16014 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ChgbP16014 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ChgbP16014 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ChgbP16014 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ChgbP16014 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ChgbP16014 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ChgbP16014 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ChgbP16014 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ChgbP16014 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ChgbP16014 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ChgbP16014 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ChgbP16014 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ChgbP16014 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ChgbP16014 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ChgbP16014 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ChgbP16014 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ChgbP16014 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ChgbP16014 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ChgbP16014 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ChgbP16014 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ChgbP16014 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ChgbP16014 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ChgbP16014 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ChgbP16014 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ChgbP16014 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ChgbP16014 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ChgbP16014 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ChgbP16014 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ChgbP16014 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ChgbP16014 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ChgbP16014 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ChgbP16014 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ChgbP16014 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ChgbP16014 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ChgbP16014 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ChgbP16014 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ChgbP16014 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ChgbP16014 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ChgbP16014 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ChgbP16014 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ChgbP16014 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ChgbP16014 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ChgbP16014 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ChgbP16014 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms