Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PrphP15331 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PrphP15331 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PrphP15331 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PrphP15331 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PrphP15331 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PrphP15331 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PrphP15331 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PrphP15331 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PrphP15331 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PrphP15331 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PrphP15331 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PrphP15331 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PrphP15331 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PrphP15331 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PrphP15331 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PrphP15331 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PrphP15331 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PrphP15331 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PrphP15331 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PrphP15331 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PrphP15331 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PrphP15331 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PrphP15331 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PrphP15331 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PrphP15331 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PrphP15331 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PrphP15331 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PrphP15331 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PrphP15331 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PrphP15331 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PrphP15331 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PrphP15331 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PrphP15331 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PrphP15331 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PrphP15331 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PrphP15331 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PrphP15331 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PrphP15331 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PrphP15331 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PrphP15331 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PrphP15331 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PrphP15331 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PrphP15331 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PrphP15331 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PrphP15331 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PrphP15331 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PrphP15331 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PrphP15331 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PrphP15331 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PrphP15331 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PrphP15331 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PrphP15331 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PrphP15331 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PrphP15331 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PrphP15331 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PrphP15331 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PrphP15331 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PrphP15331 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PrphP15331 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PrphP15331 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PrphP15331 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PrphP15331 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PrphP15331 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PrphP15331 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PrphP15331 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PrphP15331 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PrphP15331 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PrphP15331 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PrphP15331 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PrphP15331 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PrphP15331 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PrphP15331 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PrphP15331 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PrphP15331 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PrphP15331 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PrphP15331 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
PrphP15331 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PrphP15331 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PrphP15331 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PrphP15331 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PrphP15331 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PrphP15331 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PrphP15331 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PrphP15331 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PrphP15331 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PrphP15331 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PrphP15331 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PrphP15331 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PrphP15331 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PrphP15331 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PrphP15331 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PrphP15331 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PrphP15331 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PrphP15331 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PrphP15331 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PrphP15331 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PrphP15331 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PrphP15331 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PrphP15331 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms