Protein–RNA interactions for Protein: P13412

Tnni2, Troponin I, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni2P13412 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30,28■■■□□ 2,44
Tnni2P13412 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
Tnni2P13412 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
Tnni2P13412 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,26■■■□□ 2,44
Tnni2P13412 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,26■■■□□ 2,44
Tnni2P13412 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,26■■■□□ 2,43
Tnni2P13412 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,25■■■□□ 2,43
Tnni2P13412 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC30,25■■■□□ 2,43
Tnni2P13412 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,25■■■□□ 2,43
Tnni2P13412 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,25■■■□□ 2,43
Tnni2P13412 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,24■■■□□ 2,43
Tnni2P13412 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC30,24■■■□□ 2,43
Tnni2P13412 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC30,23■■■□□ 2,43
Tnni2P13412 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
Tnni2P13412 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
Tnni2P13412 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,43
Tnni2P13412 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC30,2■■■□□ 2,43
Tnni2P13412 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
Tnni2P13412 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30,19■■■□□ 2,42
Tnni2P13412 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
Tnni2P13412 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC30,19■■■□□ 2,42
Tnni2P13412 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
Tnni2P13412 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Tnni2P13412 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Tnni2P13412 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Tnni2P13412 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,17■■■□□ 2,42
Tnni2P13412 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Tnni2P13412 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Tnni2P13412 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Tnni2P13412 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30,16■■■□□ 2,42
Tnni2P13412 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Tnni2P13412 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC30,15■■■□□ 2,42
Tnni2P13412 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
Tnni2P13412 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Tnni2P13412 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC30,12■■■□□ 2,41
Tnni2P13412 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
Tnni2P13412 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC30,11■■■□□ 2,41
Tnni2P13412 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
Tnni2P13412 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC30,11■■■□□ 2,41
Tnni2P13412 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC30,1■■■□□ 2,41
Tnni2P13412 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Tnni2P13412 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,08■■■□□ 2,41
Tnni2P13412 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Tnni2P13412 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC30,06■■■□□ 2,4
Tnni2P13412 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
Tnni2P13412 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Tnni2P13412 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
Tnni2P13412 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Tnni2P13412 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2,39
Tnni2P13412 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Tnni2P13412 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Tnni2P13412 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29,98■■■□□ 2,39
Tnni2P13412 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Tnni2P13412 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29,96■■■□□ 2,39
Tnni2P13412 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,39
Tnni2P13412 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Tnni2P13412 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29,94■■■□□ 2,38
Tnni2P13412 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Tnni2P13412 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,94■■■□□ 2,38
Tnni2P13412 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29,94■■■□□ 2,38
Tnni2P13412 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Tnni2P13412 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC29,91■■■□□ 2,38
Tnni2P13412 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29,9■■■□□ 2,38
Tnni2P13412 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Tnni2P13412 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Tnni2P13412 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC29,88■■■□□ 2,37
Tnni2P13412 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29,87■■■□□ 2,37
Tnni2P13412 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC29,87■■■□□ 2,37
Tnni2P13412 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Tnni2P13412 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Tnni2P13412 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Tnni2P13412 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Tnni2P13412 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Tnni2P13412 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Tnni2P13412 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29,79■■■□□ 2,36
Tnni2P13412 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Tnni2P13412 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Tnni2P13412 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,36
Tnni2P13412 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Tnni2P13412 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Tnni2P13412 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Tnni2P13412 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Tnni2P13412 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,75■■■□□ 2,35
Tnni2P13412 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29,74■■■□□ 2,35
Tnni2P13412 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
Tnni2P13412 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
Tnni2P13412 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,72■■■□□ 2,35
Tnni2P13412 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Tnni2P13412 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Tnni2P13412 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,35
Tnni2P13412 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC29,7■■■□□ 2,35
Tnni2P13412 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,34
Tnni2P13412 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Tnni2P13412 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Tnni2P13412 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Tnni2P13412 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Tnni2P13412 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29,64■■■□□ 2,34
Tnni2P13412 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Tnni2P13412 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC29,63■■■□□ 2,33
Tnni2P13412 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC29,63■■■□□ 2,33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,8 ms