Protein–RNA interactions for Protein: P13346

Fosb, Protein fosB, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FosbP13346 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
FosbP13346 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
FosbP13346 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
FosbP13346 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
FosbP13346 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FosbP13346 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FosbP13346 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FosbP13346 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FosbP13346 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FosbP13346 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FosbP13346 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FosbP13346 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FosbP13346 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FosbP13346 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FosbP13346 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
FosbP13346 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FosbP13346 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
FosbP13346 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FosbP13346 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FosbP13346 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FosbP13346 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
FosbP13346 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
FosbP13346 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FosbP13346 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FosbP13346 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
FosbP13346 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FosbP13346 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FosbP13346 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FosbP13346 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
FosbP13346 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FosbP13346 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
FosbP13346 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
FosbP13346 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FosbP13346 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FosbP13346 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FosbP13346 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
FosbP13346 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
FosbP13346 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
FosbP13346 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FosbP13346 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FosbP13346 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
FosbP13346 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FosbP13346 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FosbP13346 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FosbP13346 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FosbP13346 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
FosbP13346 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
FosbP13346 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FosbP13346 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
FosbP13346 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
FosbP13346 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
FosbP13346 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FosbP13346 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FosbP13346 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FosbP13346 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
FosbP13346 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
FosbP13346 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
FosbP13346 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FosbP13346 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FosbP13346 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
FosbP13346 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
FosbP13346 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
FosbP13346 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
FosbP13346 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
FosbP13346 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FosbP13346 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
FosbP13346 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FosbP13346 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FosbP13346 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
FosbP13346 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
FosbP13346 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
FosbP13346 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
FosbP13346 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FosbP13346 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FosbP13346 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
FosbP13346 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FosbP13346 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FosbP13346 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FosbP13346 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FosbP13346 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FosbP13346 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FosbP13346 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
FosbP13346 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FosbP13346 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FosbP13346 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FosbP13346 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FosbP13346 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FosbP13346 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FosbP13346 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
FosbP13346 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
FosbP13346 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FosbP13346 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FosbP13346 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FosbP13346 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FosbP13346 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FosbP13346 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FosbP13346 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FosbP13346 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FosbP13346 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FosbP13346 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms