Protein–RNA interactions for Protein: P12960

Cntn1, Contactin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn1P12960 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cntn1P12960 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cntn1P12960 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cntn1P12960 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Cntn1P12960 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cntn1P12960 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cntn1P12960 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cntn1P12960 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cntn1P12960 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cntn1P12960 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cntn1P12960 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Cntn1P12960 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cntn1P12960 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cntn1P12960 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cntn1P12960 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cntn1P12960 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cntn1P12960 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cntn1P12960 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cntn1P12960 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cntn1P12960 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cntn1P12960 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cntn1P12960 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cntn1P12960 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cntn1P12960 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cntn1P12960 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cntn1P12960 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cntn1P12960 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cntn1P12960 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cntn1P12960 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cntn1P12960 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cntn1P12960 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cntn1P12960 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cntn1P12960 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cntn1P12960 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cntn1P12960 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cntn1P12960 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cntn1P12960 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cntn1P12960 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cntn1P12960 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cntn1P12960 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cntn1P12960 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cntn1P12960 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cntn1P12960 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cntn1P12960 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cntn1P12960 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cntn1P12960 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cntn1P12960 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cntn1P12960 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cntn1P12960 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cntn1P12960 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cntn1P12960 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cntn1P12960 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cntn1P12960 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cntn1P12960 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cntn1P12960 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cntn1P12960 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cntn1P12960 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cntn1P12960 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cntn1P12960 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cntn1P12960 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cntn1P12960 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cntn1P12960 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cntn1P12960 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cntn1P12960 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cntn1P12960 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cntn1P12960 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cntn1P12960 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cntn1P12960 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cntn1P12960 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cntn1P12960 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cntn1P12960 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cntn1P12960 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cntn1P12960 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cntn1P12960 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cntn1P12960 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cntn1P12960 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cntn1P12960 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cntn1P12960 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cntn1P12960 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cntn1P12960 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cntn1P12960 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cntn1P12960 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cntn1P12960 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cntn1P12960 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cntn1P12960 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cntn1P12960 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cntn1P12960 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cntn1P12960 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cntn1P12960 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cntn1P12960 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Cntn1P12960 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cntn1P12960 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cntn1P12960 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cntn1P12960 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cntn1P12960 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cntn1P12960 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cntn1P12960 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cntn1P12960 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cntn1P12960 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cntn1P12960 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms