Protein–RNA interactions for Protein: P11679

Krt8, Keratin, type II cytoskeletal 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt8P11679 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Krt8P11679 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Krt8P11679 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Krt8P11679 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Krt8P11679 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Krt8P11679 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Krt8P11679 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Krt8P11679 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Krt8P11679 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Krt8P11679 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Krt8P11679 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Krt8P11679 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Krt8P11679 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Krt8P11679 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Krt8P11679 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Krt8P11679 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Krt8P11679 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Krt8P11679 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Krt8P11679 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Krt8P11679 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Krt8P11679 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Krt8P11679 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Krt8P11679 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Krt8P11679 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Krt8P11679 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Krt8P11679 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Krt8P11679 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Krt8P11679 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Krt8P11679 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Krt8P11679 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Krt8P11679 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Krt8P11679 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Krt8P11679 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Krt8P11679 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Krt8P11679 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Krt8P11679 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Krt8P11679 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Krt8P11679 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Krt8P11679 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Krt8P11679 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Krt8P11679 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Krt8P11679 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Krt8P11679 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Krt8P11679 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Krt8P11679 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Krt8P11679 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Krt8P11679 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Krt8P11679 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Krt8P11679 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Krt8P11679 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Krt8P11679 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Krt8P11679 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Krt8P11679 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Krt8P11679 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Krt8P11679 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Krt8P11679 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Krt8P11679 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Krt8P11679 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Krt8P11679 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Krt8P11679 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Krt8P11679 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Krt8P11679 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Krt8P11679 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Krt8P11679 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Krt8P11679 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Krt8P11679 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Krt8P11679 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Krt8P11679 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Krt8P11679 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Krt8P11679 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Krt8P11679 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Krt8P11679 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Krt8P11679 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Krt8P11679 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Krt8P11679 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Krt8P11679 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Krt8P11679 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Krt8P11679 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Krt8P11679 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Krt8P11679 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Krt8P11679 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Krt8P11679 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Krt8P11679 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt8P11679 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Krt8P11679 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Krt8P11679 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Krt8P11679 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Krt8P11679 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Krt8P11679 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Krt8P11679 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Krt8P11679 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt8P11679 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt8P11679 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt8P11679 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt8P11679 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Krt8P11679 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Krt8P11679 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Krt8P11679 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Krt8P11679 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Krt8P11679 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms