Protein–RNA interactions for Protein: P11416

Rara, Retinoic acid receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaraP11416 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RaraP11416 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RaraP11416 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RaraP11416 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RaraP11416 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RaraP11416 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RaraP11416 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RaraP11416 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RaraP11416 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RaraP11416 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RaraP11416 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RaraP11416 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
RaraP11416 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RaraP11416 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RaraP11416 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RaraP11416 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RaraP11416 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RaraP11416 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RaraP11416 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RaraP11416 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RaraP11416 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RaraP11416 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RaraP11416 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RaraP11416 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RaraP11416 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RaraP11416 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RaraP11416 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RaraP11416 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RaraP11416 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RaraP11416 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RaraP11416 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RaraP11416 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RaraP11416 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RaraP11416 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RaraP11416 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RaraP11416 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RaraP11416 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RaraP11416 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RaraP11416 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RaraP11416 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RaraP11416 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RaraP11416 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RaraP11416 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RaraP11416 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RaraP11416 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RaraP11416 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RaraP11416 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RaraP11416 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RaraP11416 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RaraP11416 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RaraP11416 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RaraP11416 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RaraP11416 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RaraP11416 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RaraP11416 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RaraP11416 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RaraP11416 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RaraP11416 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RaraP11416 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RaraP11416 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RaraP11416 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RaraP11416 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RaraP11416 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RaraP11416 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RaraP11416 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RaraP11416 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RaraP11416 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RaraP11416 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RaraP11416 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RaraP11416 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RaraP11416 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RaraP11416 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RaraP11416 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RaraP11416 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RaraP11416 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RaraP11416 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RaraP11416 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RaraP11416 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RaraP11416 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RaraP11416 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RaraP11416 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RaraP11416 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RaraP11416 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RaraP11416 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RaraP11416 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RaraP11416 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RaraP11416 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RaraP11416 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RaraP11416 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RaraP11416 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27■■□□□ 1.91
RaraP11416 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
RaraP11416 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RaraP11416 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RaraP11416 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RaraP11416 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RaraP11416 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RaraP11416 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RaraP11416 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RaraP11416 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RaraP11416 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms