Protein–RNA interactions for Protein: P0C0P8

Nps, Neuropeptide S, mousemouse

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NpsP0C0P8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NpsP0C0P8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NpsP0C0P8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NpsP0C0P8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NpsP0C0P8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NpsP0C0P8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NpsP0C0P8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NpsP0C0P8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NpsP0C0P8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NpsP0C0P8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NpsP0C0P8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NpsP0C0P8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NpsP0C0P8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NpsP0C0P8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NpsP0C0P8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NpsP0C0P8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NpsP0C0P8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NpsP0C0P8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NpsP0C0P8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NpsP0C0P8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NpsP0C0P8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NpsP0C0P8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NpsP0C0P8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NpsP0C0P8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NpsP0C0P8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NpsP0C0P8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NpsP0C0P8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NpsP0C0P8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NpsP0C0P8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NpsP0C0P8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NpsP0C0P8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NpsP0C0P8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NpsP0C0P8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NpsP0C0P8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NpsP0C0P8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NpsP0C0P8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NpsP0C0P8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NpsP0C0P8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NpsP0C0P8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NpsP0C0P8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NpsP0C0P8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NpsP0C0P8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NpsP0C0P8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NpsP0C0P8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NpsP0C0P8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NpsP0C0P8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NpsP0C0P8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NpsP0C0P8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NpsP0C0P8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NpsP0C0P8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NpsP0C0P8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NpsP0C0P8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NpsP0C0P8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NpsP0C0P8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NpsP0C0P8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NpsP0C0P8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NpsP0C0P8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NpsP0C0P8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NpsP0C0P8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NpsP0C0P8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NpsP0C0P8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NpsP0C0P8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NpsP0C0P8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NpsP0C0P8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NpsP0C0P8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NpsP0C0P8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NpsP0C0P8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NpsP0C0P8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NpsP0C0P8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NpsP0C0P8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NpsP0C0P8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NpsP0C0P8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NpsP0C0P8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NpsP0C0P8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NpsP0C0P8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NpsP0C0P8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NpsP0C0P8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NpsP0C0P8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
NpsP0C0P8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NpsP0C0P8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NpsP0C0P8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NpsP0C0P8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NpsP0C0P8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NpsP0C0P8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NpsP0C0P8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NpsP0C0P8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NpsP0C0P8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NpsP0C0P8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NpsP0C0P8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NpsP0C0P8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NpsP0C0P8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NpsP0C0P8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NpsP0C0P8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NpsP0C0P8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NpsP0C0P8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NpsP0C0P8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NpsP0C0P8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NpsP0C0P8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NpsP0C0P8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NpsP0C0P8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms