Protein–RNA interactions for Protein: P09633

Hoxc9, Homeobox protein Hox-C9, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc9P09633 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Hoxc9P09633 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Hoxc9P09633 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Hoxc9P09633 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Hoxc9P09633 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Hoxc9P09633 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Hoxc9P09633 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Hoxc9P09633 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Hoxc9P09633 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Hoxc9P09633 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Hoxc9P09633 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Hoxc9P09633 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Hoxc9P09633 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Hoxc9P09633 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
Hoxc9P09633 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Hoxc9P09633 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Hoxc9P09633 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Hoxc9P09633 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Hoxc9P09633 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Hoxc9P09633 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Hoxc9P09633 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Hoxc9P09633 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Hoxc9P09633 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Hoxc9P09633 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Hoxc9P09633 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Hoxc9P09633 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Hoxc9P09633 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Hoxc9P09633 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Hoxc9P09633 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Hoxc9P09633 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Hoxc9P09633 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Hoxc9P09633 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Hoxc9P09633 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Hoxc9P09633 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Hoxc9P09633 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Hoxc9P09633 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Hoxc9P09633 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Hoxc9P09633 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Hoxc9P09633 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Hoxc9P09633 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Hoxc9P09633 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Hoxc9P09633 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Hoxc9P09633 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Hoxc9P09633 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Hoxc9P09633 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Hoxc9P09633 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Hoxc9P09633 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Hoxc9P09633 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
Hoxc9P09633 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Hoxc9P09633 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Hoxc9P09633 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Hoxc9P09633 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Hoxc9P09633 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC33.78■■■■□ 3
Hoxc9P09633 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Hoxc9P09633 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Hoxc9P09633 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Hoxc9P09633 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Hoxc9P09633 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Hoxc9P09633 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Hoxc9P09633 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Hoxc9P09633 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Hoxc9P09633 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Hoxc9P09633 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Hoxc9P09633 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Hoxc9P09633 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Hoxc9P09633 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Hoxc9P09633 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Hoxc9P09633 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Hoxc9P09633 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
Hoxc9P09633 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Hoxc9P09633 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
Hoxc9P09633 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Hoxc9P09633 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
Hoxc9P09633 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Hoxc9P09633 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Hoxc9P09633 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Hoxc9P09633 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Hoxc9P09633 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Hoxc9P09633 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Hoxc9P09633 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Hoxc9P09633 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Hoxc9P09633 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Hoxc9P09633 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Hoxc9P09633 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Hoxc9P09633 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Hoxc9P09633 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
Hoxc9P09633 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Hoxc9P09633 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Hoxc9P09633 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
Hoxc9P09633 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Hoxc9P09633 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Hoxc9P09633 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Hoxc9P09633 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Hoxc9P09633 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Hoxc9P09633 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Hoxc9P09633 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Hoxc9P09633 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Hoxc9P09633 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Hoxc9P09633 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Hoxc9P09633 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms