Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hoxa9P09631 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hoxa9P09631 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hoxa9P09631 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hoxa9P09631 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hoxa9P09631 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hoxa9P09631 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hoxa9P09631 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hoxa9P09631 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hoxa9P09631 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hoxa9P09631 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hoxa9P09631 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hoxa9P09631 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hoxa9P09631 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hoxa9P09631 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hoxa9P09631 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hoxa9P09631 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hoxa9P09631 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hoxa9P09631 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hoxa9P09631 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hoxa9P09631 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hoxa9P09631 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hoxa9P09631 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hoxa9P09631 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hoxa9P09631 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hoxa9P09631 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hoxa9P09631 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hoxa9P09631 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hoxa9P09631 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hoxa9P09631 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hoxa9P09631 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hoxa9P09631 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hoxa9P09631 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hoxa9P09631 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hoxa9P09631 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hoxa9P09631 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hoxa9P09631 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Hoxa9P09631 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hoxa9P09631 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hoxa9P09631 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hoxa9P09631 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hoxa9P09631 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hoxa9P09631 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hoxa9P09631 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hoxa9P09631 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Hoxa9P09631 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hoxa9P09631 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hoxa9P09631 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hoxa9P09631 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Hoxa9P09631 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hoxa9P09631 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hoxa9P09631 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hoxa9P09631 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hoxa9P09631 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hoxa9P09631 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hoxa9P09631 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hoxa9P09631 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hoxa9P09631 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hoxa9P09631 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Hoxa9P09631 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Hoxa9P09631 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hoxa9P09631 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hoxa9P09631 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hoxa9P09631 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hoxa9P09631 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hoxa9P09631 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hoxa9P09631 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hoxa9P09631 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hoxa9P09631 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hoxa9P09631 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hoxa9P09631 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hoxa9P09631 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hoxa9P09631 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hoxa9P09631 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Hoxa9P09631 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Hoxa9P09631 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Hoxa9P09631 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hoxa9P09631 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hoxa9P09631 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hoxa9P09631 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxa9P09631 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxa9P09631 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hoxa9P09631 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Hoxa9P09631 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Hoxa9P09631 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Hoxa9P09631 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxa9P09631 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxa9P09631 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxa9P09631 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxa9P09631 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Hoxa9P09631 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hoxa9P09631 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hoxa9P09631 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hoxa9P09631 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hoxa9P09631 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hoxa9P09631 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hoxa9P09631 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hoxa9P09631 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hoxa9P09631 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hoxa9P09631 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms