Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Hoxc8P09025 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Hoxc8P09025 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Hoxc8P09025 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Hoxc8P09025 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Hoxc8P09025 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Hoxc8P09025 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Hoxc8P09025 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Hoxc8P09025 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Hoxc8P09025 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Hoxc8P09025 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Hoxc8P09025 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hoxc8P09025 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hoxc8P09025 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Hoxc8P09025 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Hoxc8P09025 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Hoxc8P09025 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Hoxc8P09025 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Hoxc8P09025 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Hoxc8P09025 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Hoxc8P09025 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Hoxc8P09025 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Hoxc8P09025 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Hoxc8P09025 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hoxc8P09025 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hoxc8P09025 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hoxc8P09025 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hoxc8P09025 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Hoxc8P09025 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Hoxc8P09025 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Hoxc8P09025 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Hoxc8P09025 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Hoxc8P09025 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Hoxc8P09025 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Hoxc8P09025 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Hoxc8P09025 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Hoxc8P09025 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Hoxc8P09025 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Hoxc8P09025 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Hoxc8P09025 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Hoxc8P09025 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Hoxc8P09025 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Hoxc8P09025 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Hoxc8P09025 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Hoxc8P09025 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Hoxc8P09025 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Hoxc8P09025 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Hoxc8P09025 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Hoxc8P09025 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hoxc8P09025 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hoxc8P09025 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hoxc8P09025 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hoxc8P09025 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hoxc8P09025 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hoxc8P09025 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Hoxc8P09025 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Hoxc8P09025 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Hoxc8P09025 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hoxc8P09025 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Hoxc8P09025 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hoxc8P09025 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hoxc8P09025 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Hoxc8P09025 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hoxc8P09025 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Hoxc8P09025 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Hoxc8P09025 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Hoxc8P09025 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Hoxc8P09025 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Hoxc8P09025 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Hoxc8P09025 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Hoxc8P09025 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Hoxc8P09025 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Hoxc8P09025 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Hoxc8P09025 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Hoxc8P09025 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hoxc8P09025 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Hoxc8P09025 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Hoxc8P09025 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Hoxc8P09025 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hoxc8P09025 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hoxc8P09025 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Hoxc8P09025 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Hoxc8P09025 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Hoxc8P09025 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Hoxc8P09025 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Hoxc8P09025 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Hoxc8P09025 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Hoxc8P09025 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hoxc8P09025 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hoxc8P09025 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hoxc8P09025 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Hoxc8P09025 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hoxc8P09025 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Hoxc8P09025 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Hoxc8P09025 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Hoxc8P09025 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Hoxc8P09025 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Hoxc8P09025 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Hoxc8P09025 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Hoxc8P09025 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms