Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PdgfrbP05622 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PdgfrbP05622 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PdgfrbP05622 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PdgfrbP05622 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PdgfrbP05622 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PdgfrbP05622 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PdgfrbP05622 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PdgfrbP05622 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PdgfrbP05622 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PdgfrbP05622 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PdgfrbP05622 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PdgfrbP05622 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PdgfrbP05622 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PdgfrbP05622 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PdgfrbP05622 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PdgfrbP05622 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PdgfrbP05622 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PdgfrbP05622 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PdgfrbP05622 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PdgfrbP05622 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PdgfrbP05622 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PdgfrbP05622 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PdgfrbP05622 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PdgfrbP05622 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PdgfrbP05622 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PdgfrbP05622 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PdgfrbP05622 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PdgfrbP05622 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PdgfrbP05622 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PdgfrbP05622 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PdgfrbP05622 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PdgfrbP05622 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PdgfrbP05622 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PdgfrbP05622 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PdgfrbP05622 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PdgfrbP05622 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PdgfrbP05622 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PdgfrbP05622 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PdgfrbP05622 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PdgfrbP05622 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PdgfrbP05622 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PdgfrbP05622 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PdgfrbP05622 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PdgfrbP05622 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PdgfrbP05622 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PdgfrbP05622 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PdgfrbP05622 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PdgfrbP05622 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PdgfrbP05622 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PdgfrbP05622 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PdgfrbP05622 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PdgfrbP05622 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PdgfrbP05622 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PdgfrbP05622 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PdgfrbP05622 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PdgfrbP05622 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PdgfrbP05622 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PdgfrbP05622 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PdgfrbP05622 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PdgfrbP05622 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PdgfrbP05622 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PdgfrbP05622 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PdgfrbP05622 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PdgfrbP05622 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PdgfrbP05622 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PdgfrbP05622 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PdgfrbP05622 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PdgfrbP05622 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PdgfrbP05622 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PdgfrbP05622 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PdgfrbP05622 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PdgfrbP05622 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PdgfrbP05622 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PdgfrbP05622 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PdgfrbP05622 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PdgfrbP05622 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PdgfrbP05622 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PdgfrbP05622 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PdgfrbP05622 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PdgfrbP05622 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PdgfrbP05622 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PdgfrbP05622 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PdgfrbP05622 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PdgfrbP05622 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PdgfrbP05622 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PdgfrbP05622 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PdgfrbP05622 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PdgfrbP05622 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PdgfrbP05622 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PdgfrbP05622 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PdgfrbP05622 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PdgfrbP05622 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PdgfrbP05622 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PdgfrbP05622 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PdgfrbP05622 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PdgfrbP05622 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PdgfrbP05622 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PdgfrbP05622 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PdgfrbP05622 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
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