Protein–RNA interactions for Protein: P04342

Crygd, Gamma-crystallin D, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrygdP04342 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CrygdP04342 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CrygdP04342 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CrygdP04342 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CrygdP04342 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CrygdP04342 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CrygdP04342 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CrygdP04342 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CrygdP04342 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CrygdP04342 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CrygdP04342 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CrygdP04342 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CrygdP04342 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CrygdP04342 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CrygdP04342 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CrygdP04342 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CrygdP04342 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CrygdP04342 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CrygdP04342 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CrygdP04342 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CrygdP04342 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CrygdP04342 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CrygdP04342 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CrygdP04342 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CrygdP04342 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CrygdP04342 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CrygdP04342 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CrygdP04342 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CrygdP04342 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CrygdP04342 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CrygdP04342 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CrygdP04342 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CrygdP04342 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CrygdP04342 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CrygdP04342 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CrygdP04342 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CrygdP04342 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CrygdP04342 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CrygdP04342 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CrygdP04342 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CrygdP04342 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CrygdP04342 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CrygdP04342 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CrygdP04342 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CrygdP04342 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CrygdP04342 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CrygdP04342 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CrygdP04342 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CrygdP04342 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CrygdP04342 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CrygdP04342 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CrygdP04342 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CrygdP04342 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CrygdP04342 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CrygdP04342 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CrygdP04342 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CrygdP04342 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CrygdP04342 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CrygdP04342 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CrygdP04342 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CrygdP04342 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CrygdP04342 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CrygdP04342 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CrygdP04342 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CrygdP04342 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CrygdP04342 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CrygdP04342 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CrygdP04342 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CrygdP04342 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CrygdP04342 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CrygdP04342 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CrygdP04342 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CrygdP04342 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CrygdP04342 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CrygdP04342 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CrygdP04342 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CrygdP04342 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CrygdP04342 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CrygdP04342 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CrygdP04342 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CrygdP04342 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CrygdP04342 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CrygdP04342 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CrygdP04342 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CrygdP04342 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CrygdP04342 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CrygdP04342 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CrygdP04342 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CrygdP04342 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CrygdP04342 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CrygdP04342 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CrygdP04342 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CrygdP04342 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CrygdP04342 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CrygdP04342 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CrygdP04342 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CrygdP04342 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CrygdP04342 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CrygdP04342 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CrygdP04342 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms