Protein–RNA interactions for Protein: P04187

Gzmb, Granzyme B(G,H), mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GzmbP04187 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GzmbP04187 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GzmbP04187 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GzmbP04187 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GzmbP04187 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GzmbP04187 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GzmbP04187 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GzmbP04187 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GzmbP04187 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GzmbP04187 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GzmbP04187 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GzmbP04187 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GzmbP04187 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GzmbP04187 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GzmbP04187 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GzmbP04187 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GzmbP04187 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GzmbP04187 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GzmbP04187 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GzmbP04187 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GzmbP04187 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GzmbP04187 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GzmbP04187 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GzmbP04187 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GzmbP04187 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GzmbP04187 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GzmbP04187 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GzmbP04187 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GzmbP04187 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GzmbP04187 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GzmbP04187 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GzmbP04187 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GzmbP04187 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GzmbP04187 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GzmbP04187 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GzmbP04187 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GzmbP04187 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GzmbP04187 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GzmbP04187 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GzmbP04187 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GzmbP04187 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GzmbP04187 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GzmbP04187 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GzmbP04187 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GzmbP04187 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GzmbP04187 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GzmbP04187 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GzmbP04187 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GzmbP04187 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GzmbP04187 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GzmbP04187 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GzmbP04187 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GzmbP04187 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GzmbP04187 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GzmbP04187 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GzmbP04187 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GzmbP04187 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GzmbP04187 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GzmbP04187 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GzmbP04187 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GzmbP04187 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GzmbP04187 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GzmbP04187 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GzmbP04187 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GzmbP04187 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GzmbP04187 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GzmbP04187 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GzmbP04187 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GzmbP04187 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GzmbP04187 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GzmbP04187 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GzmbP04187 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GzmbP04187 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GzmbP04187 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GzmbP04187 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GzmbP04187 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GzmbP04187 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GzmbP04187 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GzmbP04187 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GzmbP04187 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GzmbP04187 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GzmbP04187 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GzmbP04187 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GzmbP04187 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GzmbP04187 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GzmbP04187 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GzmbP04187 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GzmbP04187 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GzmbP04187 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GzmbP04187 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GzmbP04187 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GzmbP04187 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GzmbP04187 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GzmbP04187 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GzmbP04187 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GzmbP04187 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GzmbP04187 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GzmbP04187 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GzmbP04187 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GzmbP04187 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms