Protein–RNA interactions for Protein: P03911

Mtnd4, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtnd4P03911 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mtnd4P03911 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mtnd4P03911 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mtnd4P03911 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mtnd4P03911 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mtnd4P03911 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mtnd4P03911 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mtnd4P03911 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mtnd4P03911 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mtnd4P03911 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Mtnd4P03911 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mtnd4P03911 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mtnd4P03911 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mtnd4P03911 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mtnd4P03911 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mtnd4P03911 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mtnd4P03911 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mtnd4P03911 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mtnd4P03911 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mtnd4P03911 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mtnd4P03911 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mtnd4P03911 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mtnd4P03911 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mtnd4P03911 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mtnd4P03911 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mtnd4P03911 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mtnd4P03911 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mtnd4P03911 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mtnd4P03911 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mtnd4P03911 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mtnd4P03911 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mtnd4P03911 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Mtnd4P03911 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mtnd4P03911 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mtnd4P03911 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mtnd4P03911 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mtnd4P03911 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mtnd4P03911 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mtnd4P03911 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mtnd4P03911 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mtnd4P03911 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mtnd4P03911 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mtnd4P03911 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mtnd4P03911 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mtnd4P03911 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mtnd4P03911 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mtnd4P03911 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mtnd4P03911 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mtnd4P03911 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mtnd4P03911 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mtnd4P03911 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mtnd4P03911 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mtnd4P03911 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Mtnd4P03911 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Mtnd4P03911 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mtnd4P03911 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mtnd4P03911 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mtnd4P03911 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mtnd4P03911 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mtnd4P03911 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mtnd4P03911 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mtnd4P03911 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mtnd4P03911 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mtnd4P03911 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mtnd4P03911 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mtnd4P03911 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mtnd4P03911 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mtnd4P03911 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mtnd4P03911 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mtnd4P03911 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mtnd4P03911 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mtnd4P03911 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mtnd4P03911 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mtnd4P03911 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mtnd4P03911 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mtnd4P03911 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mtnd4P03911 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mtnd4P03911 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mtnd4P03911 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mtnd4P03911 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mtnd4P03911 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mtnd4P03911 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mtnd4P03911 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mtnd4P03911 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mtnd4P03911 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mtnd4P03911 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mtnd4P03911 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mtnd4P03911 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mtnd4P03911 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mtnd4P03911 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mtnd4P03911 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mtnd4P03911 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mtnd4P03911 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mtnd4P03911 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mtnd4P03911 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mtnd4P03911 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mtnd4P03911 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mtnd4P03911 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mtnd4P03911 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mtnd4P03911 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms