Protein–RNA interactions for Protein: P01809

Ig heavy chain V region X24, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01809 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
P01809 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
P01809 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
P01809 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
P01809 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
P01809 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
P01809 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
P01809 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
P01809 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
P01809 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
P01809 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
P01809 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
P01809 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
P01809 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
P01809 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
P01809 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
P01809 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
P01809 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
P01809 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
P01809 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
P01809 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
P01809 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
P01809 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
P01809 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
P01809 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
P01809 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
P01809 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
P01809 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
P01809 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
P01809 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
P01809 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
P01809 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
P01809 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
P01809 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
P01809 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
P01809 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
P01809 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
P01809 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
P01809 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
P01809 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
P01809 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
P01809 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
P01809 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
P01809 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
P01809 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
P01809 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
P01809 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
P01809 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
P01809 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
P01809 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
P01809 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
P01809 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
P01809 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
P01809 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
P01809 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
P01809 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
P01809 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
P01809 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
P01809 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
P01809 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
P01809 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
P01809 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
P01809 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
P01809 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
P01809 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
P01809 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
P01809 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
P01809 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
P01809 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
P01809 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
P01809 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
P01809 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
P01809 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
P01809 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
P01809 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
P01809 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
P01809 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
P01809 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
P01809 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
P01809 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
P01809 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
P01809 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
P01809 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
P01809 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
P01809 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
P01809 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
P01809 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
P01809 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
P01809 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
P01809 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
P01809 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
P01809 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
P01809 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
P01809 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
P01809 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
P01809 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
P01809 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
P01809 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
P01809 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
P01809 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms