Protein–RNA interactions for Protein: P01791

Ig heavy chain V region HPCM6, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01791 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01791 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01791 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01791 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01791 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01791 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
P01791 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01791 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01791 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01791 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01791 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01791 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01791 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01791 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01791 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01791 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01791 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01791 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01791 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01791 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01791 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01791 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01791 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01791 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
P01791 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01791 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
P01791 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01791 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01791 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01791 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01791 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01791 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
P01791 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01791 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01791 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01791 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01791 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01791 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
P01791 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01791 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01791 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01791 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01791 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01791 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01791 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01791 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01791 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01791 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01791 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01791 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01791 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01791 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01791 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01791 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
P01791 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
P01791 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01791 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01791 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01791 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01791 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01791 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01791 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01791 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01791 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01791 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01791 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01791 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01791 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01791 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01791 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01791 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01791 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01791 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
P01791 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01791 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01791 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01791 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01791 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01791 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01791 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01791 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01791 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01791 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01791 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01791 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01791 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01791 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01791 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01791 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01791 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01791 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01791 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01791 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01791 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01791 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01791 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01791 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01791 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01791 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01791 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms