Protein–RNA interactions for Protein: P01193

Pomc, Pro-opiomelanocortin, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PomcP01193 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PomcP01193 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PomcP01193 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PomcP01193 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PomcP01193 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PomcP01193 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PomcP01193 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PomcP01193 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PomcP01193 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PomcP01193 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PomcP01193 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PomcP01193 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PomcP01193 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PomcP01193 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PomcP01193 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PomcP01193 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PomcP01193 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PomcP01193 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PomcP01193 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PomcP01193 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PomcP01193 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PomcP01193 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PomcP01193 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PomcP01193 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PomcP01193 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PomcP01193 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PomcP01193 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PomcP01193 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PomcP01193 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PomcP01193 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PomcP01193 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PomcP01193 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PomcP01193 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PomcP01193 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PomcP01193 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PomcP01193 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PomcP01193 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PomcP01193 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PomcP01193 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PomcP01193 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PomcP01193 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PomcP01193 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PomcP01193 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PomcP01193 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PomcP01193 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PomcP01193 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PomcP01193 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PomcP01193 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PomcP01193 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PomcP01193 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PomcP01193 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PomcP01193 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PomcP01193 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PomcP01193 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PomcP01193 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PomcP01193 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PomcP01193 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PomcP01193 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PomcP01193 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PomcP01193 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PomcP01193 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PomcP01193 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PomcP01193 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PomcP01193 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PomcP01193 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PomcP01193 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PomcP01193 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PomcP01193 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PomcP01193 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PomcP01193 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PomcP01193 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PomcP01193 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PomcP01193 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PomcP01193 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PomcP01193 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PomcP01193 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PomcP01193 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PomcP01193 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PomcP01193 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PomcP01193 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PomcP01193 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PomcP01193 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PomcP01193 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PomcP01193 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PomcP01193 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PomcP01193 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PomcP01193 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PomcP01193 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PomcP01193 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PomcP01193 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PomcP01193 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PomcP01193 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PomcP01193 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PomcP01193 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PomcP01193 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PomcP01193 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PomcP01193 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PomcP01193 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PomcP01193 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PomcP01193 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms