Protein–RNA interactions for Protein: O89026

Robo1, Roundabout homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo1O89026 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC34,63■■■■□ 3,13
Robo1O89026 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC34,63■■■■□ 3,13
Robo1O89026 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC34,61■■■■□ 3,13
Robo1O89026 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC34,6■■■■□ 3,13
Robo1O89026 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,59■■■■□ 3,13
Robo1O89026 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,57■■■■□ 3,12
Robo1O89026 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC34,56■■■■□ 3,12
Robo1O89026 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,56■■■■□ 3,12
Robo1O89026 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC34,56■■■■□ 3,12
Robo1O89026 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC34,55■■■■□ 3,12
Robo1O89026 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC34,54■■■■□ 3,12
Robo1O89026 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC34,54■■■■□ 3,12
Robo1O89026 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,53■■■■□ 3,12
Robo1O89026 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC34,53■■■■□ 3,12
Robo1O89026 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,52■■■■□ 3,12
Robo1O89026 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,52■■■■□ 3,12
Robo1O89026 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,51■■■■□ 3,11
Robo1O89026 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,49■■■■□ 3,11
Robo1O89026 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,48■■■■□ 3,11
Robo1O89026 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC34,47■■■■□ 3,11
Robo1O89026 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC34,45■■■■□ 3,11
Robo1O89026 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,44■■■■□ 3,1
Robo1O89026 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,43■■■■□ 3,1
Robo1O89026 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,43■■■■□ 3,1
Robo1O89026 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,41■■■■□ 3,1
Robo1O89026 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC34,41■■■■□ 3,1
Robo1O89026 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC34,39■■■■□ 3,1
Robo1O89026 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,38■■■■□ 3,09
Robo1O89026 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,37■■■■□ 3,09
Robo1O89026 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC34,34■■■■□ 3,09
Robo1O89026 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC34,33■■■■□ 3,09
Robo1O89026 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC34,32■■■■□ 3,09
Robo1O89026 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,32■■■■□ 3,08
Robo1O89026 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC34,31■■■■□ 3,08
Robo1O89026 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,27■■■■□ 3,08
Robo1O89026 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC34,27■■■■□ 3,08
Robo1O89026 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,26■■■■□ 3,08
Robo1O89026 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,26■■■■□ 3,08
Robo1O89026 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34,25■■■■□ 3,07
Robo1O89026 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,24■■■■□ 3,07
Robo1O89026 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34,23■■■■□ 3,07
Robo1O89026 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC34,23■■■■□ 3,07
Robo1O89026 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,22■■■■□ 3,07
Robo1O89026 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,22■■■■□ 3,07
Robo1O89026 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC34,19■■■■□ 3,06
Robo1O89026 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,18■■■■□ 3,06
Robo1O89026 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,17■■■■□ 3,06
Robo1O89026 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34,14■■■■□ 3,06
Robo1O89026 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,14■■■■□ 3,06
Robo1O89026 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,14■■■■□ 3,06
Robo1O89026 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,13■■■■□ 3,05
Robo1O89026 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC34,12■■■■□ 3,05
Robo1O89026 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,11■■■■□ 3,05
Robo1O89026 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,11■■■■□ 3,05
Robo1O89026 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC34,07■■■■□ 3,04
Robo1O89026 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,06■■■■□ 3,04
Robo1O89026 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,06■■■■□ 3,04
Robo1O89026 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC34,06■■■■□ 3,04
Robo1O89026 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC34,06■■■■□ 3,04
Robo1O89026 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,05■■■■□ 3,04
Robo1O89026 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC34,05■■■■□ 3,04
Robo1O89026 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC34,04■■■■□ 3,04
Robo1O89026 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,03■■■■□ 3,04
Robo1O89026 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3,03
Robo1O89026 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC33,99■■■■□ 3,03
Robo1O89026 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC33,98■■■■□ 3,03
Robo1O89026 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC33,98■■■■□ 3,03
Robo1O89026 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33,97■■■■□ 3,03
Robo1O89026 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC33,96■■■■□ 3,03
Robo1O89026 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33,94■■■■□ 3,02
Robo1O89026 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC33,94■■■■□ 3,02
Robo1O89026 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,94■■■■□ 3,02
Robo1O89026 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC33,94■■■■□ 3,02
Robo1O89026 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC33,93■■■■□ 3,02
Robo1O89026 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,93■■■■□ 3,02
Robo1O89026 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC33,93■■■■□ 3,02
Robo1O89026 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,93■■■■□ 3,02
Robo1O89026 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC33,9■■■■□ 3,02
Robo1O89026 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,9■■■■□ 3,02
Robo1O89026 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC33,9■■■■□ 3,02
Robo1O89026 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC33,89■■■■□ 3,02
Robo1O89026 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,88■■■■□ 3,01
Robo1O89026 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC33,88■■■■□ 3,01
Robo1O89026 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,88■■■■□ 3,01
Robo1O89026 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,86■■■■□ 3,01
Robo1O89026 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,86■■■■□ 3,01
Robo1O89026 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,85■■■■□ 3,01
Robo1O89026 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,83■■■■□ 3,01
Robo1O89026 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC33,82■■■■□ 3,01
Robo1O89026 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,82■■■■□ 3
Robo1O89026 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC33,82■■■■□ 3
Robo1O89026 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC33,82■■■■□ 3
Robo1O89026 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC33,79■■■■□ 3
Robo1O89026 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,79■■■■□ 3
Robo1O89026 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC33,78■■■■□ 3
Robo1O89026 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC33,77■■■■□ 3
Robo1O89026 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,77■■■■□ 3
Robo1O89026 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,76■■■■□ 3
Robo1O89026 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,76■■■■□ 3
Robo1O89026 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33,75■■■□□ 2,99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32,3 ms