Protein–RNA interactions for Protein: O88940

Msc, Musculin, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MscO88940 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MscO88940 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MscO88940 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MscO88940 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MscO88940 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MscO88940 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MscO88940 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MscO88940 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MscO88940 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MscO88940 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MscO88940 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MscO88940 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MscO88940 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MscO88940 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MscO88940 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MscO88940 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MscO88940 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MscO88940 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MscO88940 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MscO88940 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MscO88940 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MscO88940 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MscO88940 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MscO88940 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MscO88940 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MscO88940 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MscO88940 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MscO88940 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MscO88940 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MscO88940 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MscO88940 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MscO88940 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MscO88940 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MscO88940 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MscO88940 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MscO88940 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MscO88940 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MscO88940 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MscO88940 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MscO88940 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MscO88940 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MscO88940 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MscO88940 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MscO88940 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MscO88940 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MscO88940 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MscO88940 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MscO88940 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MscO88940 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MscO88940 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MscO88940 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MscO88940 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MscO88940 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MscO88940 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MscO88940 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MscO88940 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MscO88940 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MscO88940 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MscO88940 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MscO88940 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MscO88940 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MscO88940 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MscO88940 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MscO88940 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MscO88940 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MscO88940 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MscO88940 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MscO88940 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MscO88940 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MscO88940 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MscO88940 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MscO88940 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MscO88940 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MscO88940 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MscO88940 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MscO88940 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MscO88940 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MscO88940 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MscO88940 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MscO88940 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MscO88940 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MscO88940 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MscO88940 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MscO88940 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MscO88940 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MscO88940 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MscO88940 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MscO88940 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MscO88940 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MscO88940 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MscO88940 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MscO88940 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MscO88940 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MscO88940 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MscO88940 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MscO88940 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MscO88940 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MscO88940 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MscO88940 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MscO88940 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms