Protein–RNA interactions for Protein: O88824

Jtb, Protein JTB, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JtbO88824 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
JtbO88824 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
JtbO88824 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
JtbO88824 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
JtbO88824 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
JtbO88824 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
JtbO88824 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
JtbO88824 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
JtbO88824 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
JtbO88824 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
JtbO88824 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
JtbO88824 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
JtbO88824 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
JtbO88824 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
JtbO88824 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
JtbO88824 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
JtbO88824 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
JtbO88824 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
JtbO88824 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
JtbO88824 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
JtbO88824 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
JtbO88824 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
JtbO88824 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
JtbO88824 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
JtbO88824 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
JtbO88824 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
JtbO88824 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
JtbO88824 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
JtbO88824 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
JtbO88824 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
JtbO88824 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
JtbO88824 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
JtbO88824 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
JtbO88824 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
JtbO88824 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
JtbO88824 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
JtbO88824 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
JtbO88824 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
JtbO88824 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
JtbO88824 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
JtbO88824 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
JtbO88824 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
JtbO88824 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
JtbO88824 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
JtbO88824 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
JtbO88824 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
JtbO88824 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
JtbO88824 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
JtbO88824 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
JtbO88824 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
JtbO88824 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
JtbO88824 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
JtbO88824 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
JtbO88824 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
JtbO88824 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
JtbO88824 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
JtbO88824 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
JtbO88824 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
JtbO88824 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
JtbO88824 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
JtbO88824 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
JtbO88824 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
JtbO88824 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
JtbO88824 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
JtbO88824 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
JtbO88824 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
JtbO88824 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22■■□□□ 1.11
JtbO88824 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
JtbO88824 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
JtbO88824 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
JtbO88824 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
JtbO88824 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
JtbO88824 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
JtbO88824 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
JtbO88824 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
JtbO88824 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
JtbO88824 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
JtbO88824 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
JtbO88824 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
JtbO88824 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
JtbO88824 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
JtbO88824 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
JtbO88824 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
JtbO88824 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
JtbO88824 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
JtbO88824 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
JtbO88824 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
JtbO88824 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
JtbO88824 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
JtbO88824 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
JtbO88824 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
JtbO88824 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
JtbO88824 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
JtbO88824 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
JtbO88824 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
JtbO88824 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
JtbO88824 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
JtbO88824 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
JtbO88824 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
JtbO88824 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.6 ms