Protein–RNA interactions for Protein: O88705

Hcn3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn3O88705 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hcn3O88705 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hcn3O88705 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hcn3O88705 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hcn3O88705 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hcn3O88705 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hcn3O88705 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hcn3O88705 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hcn3O88705 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hcn3O88705 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hcn3O88705 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hcn3O88705 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hcn3O88705 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hcn3O88705 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hcn3O88705 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hcn3O88705 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hcn3O88705 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hcn3O88705 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hcn3O88705 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hcn3O88705 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hcn3O88705 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hcn3O88705 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hcn3O88705 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hcn3O88705 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hcn3O88705 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hcn3O88705 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hcn3O88705 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hcn3O88705 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hcn3O88705 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hcn3O88705 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Hcn3O88705 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Hcn3O88705 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hcn3O88705 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hcn3O88705 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hcn3O88705 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hcn3O88705 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hcn3O88705 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Hcn3O88705 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hcn3O88705 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hcn3O88705 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hcn3O88705 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hcn3O88705 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hcn3O88705 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Hcn3O88705 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hcn3O88705 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hcn3O88705 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Hcn3O88705 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hcn3O88705 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hcn3O88705 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hcn3O88705 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hcn3O88705 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Hcn3O88705 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hcn3O88705 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hcn3O88705 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Hcn3O88705 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hcn3O88705 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hcn3O88705 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hcn3O88705 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hcn3O88705 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Hcn3O88705 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hcn3O88705 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hcn3O88705 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hcn3O88705 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hcn3O88705 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hcn3O88705 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hcn3O88705 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hcn3O88705 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Hcn3O88705 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hcn3O88705 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hcn3O88705 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hcn3O88705 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hcn3O88705 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hcn3O88705 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hcn3O88705 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hcn3O88705 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hcn3O88705 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hcn3O88705 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hcn3O88705 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hcn3O88705 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hcn3O88705 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hcn3O88705 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hcn3O88705 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hcn3O88705 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hcn3O88705 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hcn3O88705 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hcn3O88705 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hcn3O88705 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hcn3O88705 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hcn3O88705 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hcn3O88705 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hcn3O88705 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hcn3O88705 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hcn3O88705 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hcn3O88705 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Hcn3O88705 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hcn3O88705 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hcn3O88705 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hcn3O88705 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hcn3O88705 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hcn3O88705 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms