Protein–RNA interactions for Protein: O88667

Rrad, GTP-binding protein RAD, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RradO88667 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RradO88667 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RradO88667 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RradO88667 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RradO88667 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RradO88667 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RradO88667 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RradO88667 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RradO88667 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RradO88667 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RradO88667 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RradO88667 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RradO88667 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RradO88667 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RradO88667 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RradO88667 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RradO88667 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RradO88667 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RradO88667 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RradO88667 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RradO88667 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RradO88667 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RradO88667 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RradO88667 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RradO88667 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RradO88667 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RradO88667 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RradO88667 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RradO88667 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RradO88667 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RradO88667 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RradO88667 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RradO88667 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RradO88667 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RradO88667 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RradO88667 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RradO88667 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RradO88667 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RradO88667 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RradO88667 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RradO88667 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RradO88667 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RradO88667 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RradO88667 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RradO88667 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RradO88667 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RradO88667 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RradO88667 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RradO88667 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RradO88667 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RradO88667 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RradO88667 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RradO88667 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RradO88667 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RradO88667 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RradO88667 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RradO88667 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RradO88667 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RradO88667 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RradO88667 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RradO88667 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RradO88667 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RradO88667 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RradO88667 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RradO88667 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RradO88667 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RradO88667 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RradO88667 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RradO88667 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RradO88667 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RradO88667 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RradO88667 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RradO88667 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RradO88667 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RradO88667 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RradO88667 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RradO88667 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RradO88667 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RradO88667 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RradO88667 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RradO88667 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RradO88667 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RradO88667 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RradO88667 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RradO88667 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RradO88667 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RradO88667 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RradO88667 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RradO88667 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RradO88667 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RradO88667 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
RradO88667 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
RradO88667 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RradO88667 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RradO88667 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RradO88667 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RradO88667 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RradO88667 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RradO88667 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RradO88667 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms