Protein–RNA interactions for Protein: O88485

Dync1i1, Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dync1i1O88485 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Dync1i1O88485 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Dync1i1O88485 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Dync1i1O88485 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Dync1i1O88485 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Dync1i1O88485 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Dync1i1O88485 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Dync1i1O88485 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Dync1i1O88485 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Dync1i1O88485 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Dync1i1O88485 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Dync1i1O88485 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Dync1i1O88485 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Dync1i1O88485 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Dync1i1O88485 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Dync1i1O88485 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Dync1i1O88485 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Dync1i1O88485 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Dync1i1O88485 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Dync1i1O88485 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Dync1i1O88485 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Dync1i1O88485 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Dync1i1O88485 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Dync1i1O88485 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Dync1i1O88485 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Dync1i1O88485 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Dync1i1O88485 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Dync1i1O88485 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Dync1i1O88485 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Dync1i1O88485 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Dync1i1O88485 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Dync1i1O88485 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Dync1i1O88485 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Dync1i1O88485 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Dync1i1O88485 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Dync1i1O88485 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Dync1i1O88485 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Dync1i1O88485 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Dync1i1O88485 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Dync1i1O88485 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Dync1i1O88485 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Dync1i1O88485 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Dync1i1O88485 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Dync1i1O88485 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Dync1i1O88485 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Dync1i1O88485 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Dync1i1O88485 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Dync1i1O88485 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Dync1i1O88485 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Dync1i1O88485 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Dync1i1O88485 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Dync1i1O88485 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Dync1i1O88485 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Dync1i1O88485 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Dync1i1O88485 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Dync1i1O88485 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Dync1i1O88485 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Dync1i1O88485 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Dync1i1O88485 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Dync1i1O88485 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Dync1i1O88485 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Dync1i1O88485 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Dync1i1O88485 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Dync1i1O88485 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Dync1i1O88485 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Dync1i1O88485 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Dync1i1O88485 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Dync1i1O88485 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Dync1i1O88485 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Dync1i1O88485 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Dync1i1O88485 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Dync1i1O88485 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Dync1i1O88485 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Dync1i1O88485 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Dync1i1O88485 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Dync1i1O88485 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Dync1i1O88485 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Dync1i1O88485 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Dync1i1O88485 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Dync1i1O88485 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Dync1i1O88485 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Dync1i1O88485 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Dync1i1O88485 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Dync1i1O88485 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Dync1i1O88485 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Dync1i1O88485 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Dync1i1O88485 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Dync1i1O88485 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Dync1i1O88485 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Dync1i1O88485 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Dync1i1O88485 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Dync1i1O88485 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Dync1i1O88485 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Dync1i1O88485 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Dync1i1O88485 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Dync1i1O88485 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Dync1i1O88485 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Dync1i1O88485 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Dync1i1O88485 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Dync1i1O88485 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms