Protein–RNA interactions for Protein: O88322

Nid2, Nidogen-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid2O88322 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,63■■■■□ 3,13
Nid2O88322 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,62■■■■□ 3,13
Nid2O88322 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC34,62■■■■□ 3,13
Nid2O88322 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC34,61■■■■□ 3,13
Nid2O88322 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,59■■■■□ 3,13
Nid2O88322 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,58■■■■□ 3,13
Nid2O88322 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,57■■■■□ 3,13
Nid2O88322 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34,57■■■■□ 3,12
Nid2O88322 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC34,56■■■■□ 3,12
Nid2O88322 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,55■■■■□ 3,12
Nid2O88322 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,53■■■■□ 3,12
Nid2O88322 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC34,53■■■■□ 3,12
Nid2O88322 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,52■■■■□ 3,12
Nid2O88322 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC34,52■■■■□ 3,12
Nid2O88322 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34,51■■■■□ 3,12
Nid2O88322 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,5■■■■□ 3,11
Nid2O88322 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,48■■■■□ 3,11
Nid2O88322 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC34,48■■■■□ 3,11
Nid2O88322 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC34,47■■■■□ 3,11
Nid2O88322 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC34,44■■■■□ 3,1
Nid2O88322 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC34,42■■■■□ 3,1
Nid2O88322 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC34,42■■■■□ 3,1
Nid2O88322 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,41■■■■□ 3,1
Nid2O88322 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,4■■■■□ 3,1
Nid2O88322 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,39■■■■□ 3,1
Nid2O88322 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC34,39■■■■□ 3,1
Nid2O88322 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,36■■■■□ 3,09
Nid2O88322 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,35■■■■□ 3,09
Nid2O88322 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34,33■■■■□ 3,09
Nid2O88322 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC34,31■■■■□ 3,08
Nid2O88322 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,29■■■■□ 3,08
Nid2O88322 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,29■■■■□ 3,08
Nid2O88322 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,27■■■■□ 3,08
Nid2O88322 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,27■■■■□ 3,08
Nid2O88322 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,25■■■■□ 3,07
Nid2O88322 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC34,25■■■■□ 3,07
Nid2O88322 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC34,24■■■■□ 3,07
Nid2O88322 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,24■■■■□ 3,07
Nid2O88322 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,23■■■■□ 3,07
Nid2O88322 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,22■■■■□ 3,07
Nid2O88322 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,22■■■■□ 3,07
Nid2O88322 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34,19■■■■□ 3,06
Nid2O88322 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC34,19■■■■□ 3,06
Nid2O88322 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC34,19■■■■□ 3,06
Nid2O88322 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,18■■■■□ 3,06
Nid2O88322 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,16■■■■□ 3,06
Nid2O88322 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC34,16■■■■□ 3,06
Nid2O88322 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,15■■■■□ 3,06
Nid2O88322 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC34,15■■■■□ 3,06
Nid2O88322 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC34,13■■■■□ 3,05
Nid2O88322 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC34,13■■■■□ 3,05
Nid2O88322 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,13■■■■□ 3,05
Nid2O88322 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC34,12■■■■□ 3,05
Nid2O88322 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,11■■■■□ 3,05
Nid2O88322 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,1■■■■□ 3,05
Nid2O88322 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,1■■■■□ 3,05
Nid2O88322 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC34,09■■■■□ 3,05
Nid2O88322 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,09■■■■□ 3,05
Nid2O88322 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC34,08■■■■□ 3,05
Nid2O88322 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,07■■■■□ 3,05
Nid2O88322 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34,07■■■■□ 3,04
Nid2O88322 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC34,06■■■■□ 3,04
Nid2O88322 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,05■■■■□ 3,04
Nid2O88322 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34,03■■■■□ 3,04
Nid2O88322 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,03■■■■□ 3,04
Nid2O88322 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,01■■■■□ 3,04
Nid2O88322 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,01■■■■□ 3,04
Nid2O88322 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3,03
Nid2O88322 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3,03
Nid2O88322 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3,03
Nid2O88322 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,95■■■■□ 3,02
Nid2O88322 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC33,95■■■■□ 3,02
Nid2O88322 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,95■■■■□ 3,02
Nid2O88322 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC33,92■■■■□ 3,02
Nid2O88322 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,92■■■■□ 3,02
Nid2O88322 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33,92■■■■□ 3,02
Nid2O88322 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC33,91■■■■□ 3,02
Nid2O88322 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC33,89■■■■□ 3,02
Nid2O88322 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,88■■■■□ 3,01
Nid2O88322 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,87■■■■□ 3,01
Nid2O88322 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,87■■■■□ 3,01
Nid2O88322 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC33,87■■■■□ 3,01
Nid2O88322 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC33,84■■■■□ 3,01
Nid2O88322 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,84■■■■□ 3,01
Nid2O88322 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC33,83■■■■□ 3,01
Nid2O88322 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC33,83■■■■□ 3,01
Nid2O88322 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC33,82■■■■□ 3
Nid2O88322 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC33,82■■■■□ 3
Nid2O88322 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,82■■■■□ 3
Nid2O88322 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,82■■■■□ 3
Nid2O88322 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,8■■■■□ 3
Nid2O88322 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC33,8■■■■□ 3
Nid2O88322 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,79■■■■□ 3
Nid2O88322 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,79■■■■□ 3
Nid2O88322 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC33,79■■■■□ 3
Nid2O88322 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC33,78■■■■□ 3
Nid2O88322 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,78■■■■□ 3
Nid2O88322 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,78■■■■□ 3
Nid2O88322 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,77■■■■□ 3
Nid2O88322 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33,75■■■□□ 2,99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,8 ms