Protein–RNA interactions for Protein: O70507

Hcn4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn4O70507 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Hcn4O70507 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27,41■■□□□ 1,98
Hcn4O70507 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27,41■■□□□ 1,98
Hcn4O70507 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Hcn4O70507 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Hcn4O70507 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,4■■□□□ 1,98
Hcn4O70507 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,98
Hcn4O70507 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,98
Hcn4O70507 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,98
Hcn4O70507 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Hcn4O70507 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27,37■■□□□ 1,97
Hcn4O70507 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Hcn4O70507 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27,36■■□□□ 1,97
Hcn4O70507 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,36■■□□□ 1,97
Hcn4O70507 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Hcn4O70507 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Hcn4O70507 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Hcn4O70507 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Hcn4O70507 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Hcn4O70507 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Hcn4O70507 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27,28■■□□□ 1,96
Hcn4O70507 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Hcn4O70507 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Hcn4O70507 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27,25■■□□□ 1,95
Hcn4O70507 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27,25■■□□□ 1,95
Hcn4O70507 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Hcn4O70507 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27,23■■□□□ 1,95
Hcn4O70507 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27,22■■□□□ 1,95
Hcn4O70507 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,94
Hcn4O70507 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27,19■■□□□ 1,94
Hcn4O70507 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Hcn4O70507 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Hcn4O70507 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27,16■■□□□ 1,94
Hcn4O70507 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Hcn4O70507 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Hcn4O70507 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Hcn4O70507 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27,14■■□□□ 1,94
Hcn4O70507 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Hcn4O70507 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Hcn4O70507 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Hcn4O70507 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27,12■■□□□ 1,93
Hcn4O70507 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,11■■□□□ 1,93
Hcn4O70507 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,11■■□□□ 1,93
Hcn4O70507 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Hcn4O70507 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Hcn4O70507 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27,1■■□□□ 1,93
Hcn4O70507 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,09■■□□□ 1,93
Hcn4O70507 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Hcn4O70507 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Hcn4O70507 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27,08■■□□□ 1,93
Hcn4O70507 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,08■■□□□ 1,93
Hcn4O70507 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Hcn4O70507 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Hcn4O70507 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27,04■■□□□ 1,92
Hcn4O70507 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Hcn4O70507 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Hcn4O70507 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27,02■■□□□ 1,92
Hcn4O70507 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Hcn4O70507 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,01■■□□□ 1,91
Hcn4O70507 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Hcn4O70507 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1,91
Hcn4O70507 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Hcn4O70507 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26,99■■□□□ 1,91
Hcn4O70507 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Hcn4O70507 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Hcn4O70507 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Hcn4O70507 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26,97■■□□□ 1,91
Hcn4O70507 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Hcn4O70507 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Hcn4O70507 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Hcn4O70507 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Hcn4O70507 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Hcn4O70507 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26,94■■□□□ 1,9
Hcn4O70507 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,94■■□□□ 1,9
Hcn4O70507 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Hcn4O70507 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Hcn4O70507 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Hcn4O70507 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Hcn4O70507 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Hcn4O70507 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26,87■■□□□ 1,89
Hcn4O70507 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Hcn4O70507 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26,85■■□□□ 1,89
Hcn4O70507 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Hcn4O70507 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Hcn4O70507 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Hcn4O70507 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Hcn4O70507 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,82■■□□□ 1,88
Hcn4O70507 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26,81■■□□□ 1,88
Hcn4O70507 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26,81■■□□□ 1,88
Hcn4O70507 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26,8■■□□□ 1,88
Hcn4O70507 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26,78■■□□□ 1,88
Hcn4O70507 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Hcn4O70507 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Hcn4O70507 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Hcn4O70507 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Hcn4O70507 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26,75■■□□□ 1,87
Hcn4O70507 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,73■■□□□ 1,87
Hcn4O70507 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,73■■□□□ 1,87
Hcn4O70507 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Hcn4O70507 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13,1 ms