Protein–RNA interactions for Protein: O70492

Snx3, Sorting nexin-3, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx3O70492 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snx3O70492 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snx3O70492 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snx3O70492 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snx3O70492 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snx3O70492 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Snx3O70492 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Snx3O70492 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Snx3O70492 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Snx3O70492 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snx3O70492 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snx3O70492 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snx3O70492 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snx3O70492 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snx3O70492 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snx3O70492 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snx3O70492 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snx3O70492 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Snx3O70492 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snx3O70492 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snx3O70492 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snx3O70492 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snx3O70492 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Snx3O70492 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snx3O70492 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snx3O70492 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snx3O70492 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snx3O70492 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snx3O70492 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snx3O70492 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snx3O70492 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snx3O70492 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snx3O70492 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snx3O70492 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snx3O70492 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snx3O70492 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snx3O70492 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snx3O70492 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snx3O70492 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snx3O70492 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snx3O70492 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snx3O70492 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snx3O70492 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snx3O70492 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snx3O70492 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snx3O70492 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Snx3O70492 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snx3O70492 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snx3O70492 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Snx3O70492 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Snx3O70492 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Snx3O70492 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Snx3O70492 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Snx3O70492 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snx3O70492 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snx3O70492 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snx3O70492 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Snx3O70492 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snx3O70492 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snx3O70492 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snx3O70492 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snx3O70492 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snx3O70492 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snx3O70492 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snx3O70492 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snx3O70492 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snx3O70492 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snx3O70492 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snx3O70492 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Snx3O70492 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snx3O70492 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snx3O70492 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Snx3O70492 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snx3O70492 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snx3O70492 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snx3O70492 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snx3O70492 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snx3O70492 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snx3O70492 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snx3O70492 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snx3O70492 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snx3O70492 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snx3O70492 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snx3O70492 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snx3O70492 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snx3O70492 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snx3O70492 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx3O70492 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx3O70492 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Snx3O70492 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snx3O70492 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snx3O70492 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snx3O70492 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snx3O70492 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx3O70492 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snx3O70492 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snx3O70492 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snx3O70492 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snx3O70492 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snx3O70492 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms