Protein–RNA interactions for Protein: O70404

Vamp8, Vesicle-associated membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp8O70404 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vamp8O70404 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vamp8O70404 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vamp8O70404 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vamp8O70404 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vamp8O70404 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp8O70404 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp8O70404 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vamp8O70404 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vamp8O70404 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vamp8O70404 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp8O70404 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp8O70404 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp8O70404 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp8O70404 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp8O70404 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp8O70404 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vamp8O70404 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vamp8O70404 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vamp8O70404 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vamp8O70404 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vamp8O70404 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vamp8O70404 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vamp8O70404 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vamp8O70404 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vamp8O70404 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vamp8O70404 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vamp8O70404 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vamp8O70404 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vamp8O70404 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vamp8O70404 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vamp8O70404 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vamp8O70404 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Vamp8O70404 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp8O70404 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vamp8O70404 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vamp8O70404 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp8O70404 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp8O70404 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp8O70404 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp8O70404 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp8O70404 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp8O70404 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp8O70404 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp8O70404 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp8O70404 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp8O70404 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp8O70404 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp8O70404 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp8O70404 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp8O70404 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp8O70404 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp8O70404 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp8O70404 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp8O70404 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp8O70404 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp8O70404 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp8O70404 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp8O70404 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp8O70404 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp8O70404 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vamp8O70404 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vamp8O70404 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vamp8O70404 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp8O70404 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp8O70404 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp8O70404 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp8O70404 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp8O70404 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp8O70404 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp8O70404 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp8O70404 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp8O70404 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp8O70404 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp8O70404 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp8O70404 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp8O70404 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp8O70404 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vamp8O70404 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vamp8O70404 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vamp8O70404 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vamp8O70404 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vamp8O70404 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vamp8O70404 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vamp8O70404 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vamp8O70404 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vamp8O70404 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vamp8O70404 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vamp8O70404 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp8O70404 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp8O70404 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vamp8O70404 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vamp8O70404 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vamp8O70404 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vamp8O70404 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vamp8O70404 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vamp8O70404 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Vamp8O70404 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vamp8O70404 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp8O70404 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106 ms