Protein–RNA interactions for Protein: O70361

Per3, Period circadian protein homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Per3O70361 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Per3O70361 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Per3O70361 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Per3O70361 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Per3O70361 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Per3O70361 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Per3O70361 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Per3O70361 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Per3O70361 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Per3O70361 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Per3O70361 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Per3O70361 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Per3O70361 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Per3O70361 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Per3O70361 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Per3O70361 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Per3O70361 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Per3O70361 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Per3O70361 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Per3O70361 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Per3O70361 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Per3O70361 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Per3O70361 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Per3O70361 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Per3O70361 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Per3O70361 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Per3O70361 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Per3O70361 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Per3O70361 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Per3O70361 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Per3O70361 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Per3O70361 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Per3O70361 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Per3O70361 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Per3O70361 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Per3O70361 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Per3O70361 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Per3O70361 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Per3O70361 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Per3O70361 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Per3O70361 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Per3O70361 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Per3O70361 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Per3O70361 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Per3O70361 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Per3O70361 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Per3O70361 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Per3O70361 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Per3O70361 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Per3O70361 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Per3O70361 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Per3O70361 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Per3O70361 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Per3O70361 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Per3O70361 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Per3O70361 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Per3O70361 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Per3O70361 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Per3O70361 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Per3O70361 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Per3O70361 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Per3O70361 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Per3O70361 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Per3O70361 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Per3O70361 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Per3O70361 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Per3O70361 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Per3O70361 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Per3O70361 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Per3O70361 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Per3O70361 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Per3O70361 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Per3O70361 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Per3O70361 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Per3O70361 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Per3O70361 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Per3O70361 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Per3O70361 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Per3O70361 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Per3O70361 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Per3O70361 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Per3O70361 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Per3O70361 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Per3O70361 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Per3O70361 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Per3O70361 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Per3O70361 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Per3O70361 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Per3O70361 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Per3O70361 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Per3O70361 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Per3O70361 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Per3O70361 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Per3O70361 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Per3O70361 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Per3O70361 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Per3O70361 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Per3O70361 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Per3O70361 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Per3O70361 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms