Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25,8■■□□□ 1,72
Chrna4O70174 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Chrna4O70174 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Chrna4O70174 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Chrna4O70174 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,79■■□□□ 1,72
Chrna4O70174 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25,78■■□□□ 1,72
Chrna4O70174 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Chrna4O70174 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Chrna4O70174 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,78■■□□□ 1,72
Chrna4O70174 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Chrna4O70174 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Chrna4O70174 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Chrna4O70174 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Chrna4O70174 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Chrna4O70174 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Chrna4O70174 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Chrna4O70174 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Chrna4O70174 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Chrna4O70174 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25,7■■□□□ 1,7
Chrna4O70174 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Chrna4O70174 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25,68■■□□□ 1,7
Chrna4O70174 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Chrna4O70174 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Chrna4O70174 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25,66■■□□□ 1,7
Chrna4O70174 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Chrna4O70174 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25,64■■□□□ 1,7
Chrna4O70174 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,64■■□□□ 1,7
Chrna4O70174 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Chrna4O70174 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Chrna4O70174 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25,57■■□□□ 1,68
Chrna4O70174 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Chrna4O70174 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25,56■■□□□ 1,68
Chrna4O70174 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,56■■□□□ 1,68
Chrna4O70174 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Chrna4O70174 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25,55■■□□□ 1,68
Chrna4O70174 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,54■■□□□ 1,68
Chrna4O70174 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Chrna4O70174 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,52■■□□□ 1,68
Chrna4O70174 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25,52■■□□□ 1,68
Chrna4O70174 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,68
Chrna4O70174 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Chrna4O70174 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Chrna4O70174 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Chrna4O70174 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25,5■■□□□ 1,67
Chrna4O70174 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25,5■■□□□ 1,67
Chrna4O70174 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Chrna4O70174 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,5■■□□□ 1,67
Chrna4O70174 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25,5■■□□□ 1,67
Chrna4O70174 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Chrna4O70174 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Chrna4O70174 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,67
Chrna4O70174 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,67
Chrna4O70174 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Chrna4O70174 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Chrna4O70174 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,43■■□□□ 1,66
Chrna4O70174 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Chrna4O70174 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25,43■■□□□ 1,66
Chrna4O70174 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Chrna4O70174 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Chrna4O70174 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25,42■■□□□ 1,66
Chrna4O70174 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Chrna4O70174 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,41■■□□□ 1,66
Chrna4O70174 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25,41■■□□□ 1,66
Chrna4O70174 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,4■■□□□ 1,66
Chrna4O70174 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Chrna4O70174 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Chrna4O70174 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
Chrna4O70174 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Chrna4O70174 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Chrna4O70174 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Chrna4O70174 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,36■■□□□ 1,65
Chrna4O70174 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Chrna4O70174 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Chrna4O70174 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Chrna4O70174 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Chrna4O70174 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25,33■■□□□ 1,65
Chrna4O70174 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25,32■■□□□ 1,64
Chrna4O70174 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Chrna4O70174 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25,31■■□□□ 1,64
Chrna4O70174 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25,31■■□□□ 1,64
Chrna4O70174 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25,3■■□□□ 1,64
Chrna4O70174 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25,3■■□□□ 1,64
Chrna4O70174 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Chrna4O70174 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Chrna4O70174 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Chrna4O70174 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,29■■□□□ 1,64
Chrna4O70174 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Chrna4O70174 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Chrna4O70174 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Chrna4O70174 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Chrna4O70174 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Chrna4O70174 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Chrna4O70174 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25,24■■□□□ 1,63
Chrna4O70174 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Chrna4O70174 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Chrna4O70174 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25,22■■□□□ 1,63
Chrna4O70174 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Chrna4O70174 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Chrna4O70174 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Chrna4O70174 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8,4 ms