Protein–RNA interactions for Protein: O55055

Trdmt1, tRNA (cytosine(38)-C(5))-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdmt1O55055 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Trdmt1O55055 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Trdmt1O55055 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Trdmt1O55055 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Trdmt1O55055 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Trdmt1O55055 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Trdmt1O55055 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Trdmt1O55055 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Trdmt1O55055 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Trdmt1O55055 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Trdmt1O55055 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Trdmt1O55055 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Trdmt1O55055 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Trdmt1O55055 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Trdmt1O55055 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Trdmt1O55055 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Trdmt1O55055 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trdmt1O55055 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trdmt1O55055 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Trdmt1O55055 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Trdmt1O55055 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Trdmt1O55055 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trdmt1O55055 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Trdmt1O55055 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Trdmt1O55055 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Trdmt1O55055 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Trdmt1O55055 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Trdmt1O55055 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Trdmt1O55055 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Trdmt1O55055 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Trdmt1O55055 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Trdmt1O55055 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Trdmt1O55055 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Trdmt1O55055 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Trdmt1O55055 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Trdmt1O55055 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Trdmt1O55055 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Trdmt1O55055 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Trdmt1O55055 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trdmt1O55055 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trdmt1O55055 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trdmt1O55055 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trdmt1O55055 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trdmt1O55055 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Trdmt1O55055 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Trdmt1O55055 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Trdmt1O55055 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trdmt1O55055 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trdmt1O55055 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trdmt1O55055 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trdmt1O55055 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Trdmt1O55055 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Trdmt1O55055 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Trdmt1O55055 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trdmt1O55055 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Trdmt1O55055 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Trdmt1O55055 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Trdmt1O55055 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trdmt1O55055 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trdmt1O55055 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trdmt1O55055 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trdmt1O55055 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trdmt1O55055 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trdmt1O55055 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Trdmt1O55055 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Trdmt1O55055 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Trdmt1O55055 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Trdmt1O55055 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Trdmt1O55055 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Trdmt1O55055 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Trdmt1O55055 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trdmt1O55055 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trdmt1O55055 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Trdmt1O55055 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Trdmt1O55055 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Trdmt1O55055 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Trdmt1O55055 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Trdmt1O55055 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trdmt1O55055 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trdmt1O55055 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trdmt1O55055 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Trdmt1O55055 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Trdmt1O55055 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Trdmt1O55055 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Trdmt1O55055 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Trdmt1O55055 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Trdmt1O55055 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Trdmt1O55055 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Trdmt1O55055 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trdmt1O55055 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Trdmt1O55055 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Trdmt1O55055 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Trdmt1O55055 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Trdmt1O55055 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Trdmt1O55055 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Trdmt1O55055 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Trdmt1O55055 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Trdmt1O55055 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Trdmt1O55055 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Trdmt1O55055 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms