Protein–RNA interactions for Protein: O55033

Nck2, Cytoplasmic protein NCK2, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nck2O55033 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Nck2O55033 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Nck2O55033 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Nck2O55033 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Nck2O55033 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Nck2O55033 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Nck2O55033 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Nck2O55033 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Nck2O55033 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nck2O55033 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nck2O55033 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nck2O55033 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nck2O55033 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nck2O55033 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Nck2O55033 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nck2O55033 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Nck2O55033 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Nck2O55033 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Nck2O55033 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nck2O55033 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Nck2O55033 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nck2O55033 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nck2O55033 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nck2O55033 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Nck2O55033 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Nck2O55033 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Nck2O55033 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Nck2O55033 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Nck2O55033 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nck2O55033 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nck2O55033 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nck2O55033 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nck2O55033 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nck2O55033 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Nck2O55033 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nck2O55033 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nck2O55033 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nck2O55033 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nck2O55033 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Nck2O55033 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nck2O55033 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nck2O55033 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Nck2O55033 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Nck2O55033 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Nck2O55033 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Nck2O55033 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nck2O55033 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nck2O55033 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nck2O55033 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nck2O55033 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nck2O55033 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nck2O55033 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Nck2O55033 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Nck2O55033 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nck2O55033 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nck2O55033 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nck2O55033 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Nck2O55033 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nck2O55033 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nck2O55033 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nck2O55033 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nck2O55033 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nck2O55033 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nck2O55033 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Nck2O55033 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nck2O55033 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nck2O55033 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nck2O55033 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Nck2O55033 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nck2O55033 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nck2O55033 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nck2O55033 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Nck2O55033 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Nck2O55033 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Nck2O55033 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Nck2O55033 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nck2O55033 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nck2O55033 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nck2O55033 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nck2O55033 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Nck2O55033 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nck2O55033 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nck2O55033 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nck2O55033 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nck2O55033 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nck2O55033 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nck2O55033 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Nck2O55033 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nck2O55033 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nck2O55033 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nck2O55033 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nck2O55033 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Nck2O55033 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Nck2O55033 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nck2O55033 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nck2O55033 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nck2O55033 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nck2O55033 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nck2O55033 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nck2O55033 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms