Protein–RNA interactions for Protein: O54990

Prom1, Prominin-1, mousemouse

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prom1O54990 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Prom1O54990 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28,84■■■□□ 2,21
Prom1O54990 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Prom1O54990 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28,84■■■□□ 2,21
Prom1O54990 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28,82■■■□□ 2,2
Prom1O54990 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Prom1O54990 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Prom1O54990 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Prom1O54990 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,79■■■□□ 2,2
Prom1O54990 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Prom1O54990 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,78■■■□□ 2,2
Prom1O54990 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28,78■■■□□ 2,2
Prom1O54990 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Prom1O54990 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28,77■■■□□ 2,2
Prom1O54990 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28,77■■■□□ 2,2
Prom1O54990 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Prom1O54990 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Prom1O54990 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Prom1O54990 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Prom1O54990 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Prom1O54990 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,72■■■□□ 2,19
Prom1O54990 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Prom1O54990 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Prom1O54990 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28,66■■■□□ 2,18
Prom1O54990 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28,64■■■□□ 2,18
Prom1O54990 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,17
Prom1O54990 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,17
Prom1O54990 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28,63■■■□□ 2,17
Prom1O54990 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Prom1O54990 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Prom1O54990 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Prom1O54990 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Prom1O54990 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28,6■■■□□ 2,17
Prom1O54990 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Prom1O54990 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Prom1O54990 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Prom1O54990 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Prom1O54990 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Prom1O54990 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Prom1O54990 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Prom1O54990 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Prom1O54990 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Prom1O54990 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28,53■■■□□ 2,16
Prom1O54990 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28,52■■■□□ 2,16
Prom1O54990 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28,51■■■□□ 2,15
Prom1O54990 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28,5■■■□□ 2,15
Prom1O54990 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28,5■■■□□ 2,15
Prom1O54990 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Prom1O54990 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,48■■■□□ 2,15
Prom1O54990 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Prom1O54990 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Prom1O54990 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Prom1O54990 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Prom1O54990 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Prom1O54990 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Prom1O54990 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Prom1O54990 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Prom1O54990 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28,43■■■□□ 2,14
Prom1O54990 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Prom1O54990 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28,42■■■□□ 2,14
Prom1O54990 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28,42■■■□□ 2,14
Prom1O54990 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Prom1O54990 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Prom1O54990 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Prom1O54990 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28,4■■■□□ 2,14
Prom1O54990 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Prom1O54990 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Prom1O54990 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28,39■■■□□ 2,14
Prom1O54990 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28,36■■■□□ 2,13
Prom1O54990 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28,36■■■□□ 2,13
Prom1O54990 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Prom1O54990 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28,36■■■□□ 2,13
Prom1O54990 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Prom1O54990 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,33■■■□□ 2,13
Prom1O54990 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Prom1O54990 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,32■■■□□ 2,12
Prom1O54990 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,32■■■□□ 2,12
Prom1O54990 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28,3■■■□□ 2,12
Prom1O54990 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28,3■■■□□ 2,12
Prom1O54990 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28,29■■■□□ 2,12
Prom1O54990 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Prom1O54990 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Prom1O54990 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,28■■■□□ 2,12
Prom1O54990 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Prom1O54990 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Prom1O54990 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,27■■■□□ 2,12
Prom1O54990 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28,26■■■□□ 2,12
Prom1O54990 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Prom1O54990 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Prom1O54990 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Prom1O54990 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Prom1O54990 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Prom1O54990 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28,21■■■□□ 2,11
Prom1O54990 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Prom1O54990 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Prom1O54990 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Prom1O54990 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28,16■■■□□ 2,1
Prom1O54990 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Prom1O54990 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,14■■■□□ 2,1
Prom1O54990 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,1 ms