Protein–RNA interactions for Protein: O54962

Banf1, Barrier-to-autointegration factor, mousemouse

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Banf1O54962 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Banf1O54962 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Banf1O54962 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Banf1O54962 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Banf1O54962 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Banf1O54962 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Banf1O54962 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Banf1O54962 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Banf1O54962 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Banf1O54962 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Banf1O54962 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Banf1O54962 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Banf1O54962 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Banf1O54962 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Banf1O54962 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Banf1O54962 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Banf1O54962 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Banf1O54962 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Banf1O54962 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Banf1O54962 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Banf1O54962 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Banf1O54962 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Banf1O54962 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Banf1O54962 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Banf1O54962 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Banf1O54962 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Banf1O54962 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Banf1O54962 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Banf1O54962 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Banf1O54962 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Banf1O54962 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Banf1O54962 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Banf1O54962 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Banf1O54962 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Banf1O54962 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Banf1O54962 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Banf1O54962 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Banf1O54962 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Banf1O54962 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Banf1O54962 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Banf1O54962 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Banf1O54962 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Banf1O54962 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Banf1O54962 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Banf1O54962 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Banf1O54962 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Banf1O54962 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Banf1O54962 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Banf1O54962 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Banf1O54962 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Banf1O54962 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Banf1O54962 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Banf1O54962 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Banf1O54962 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Banf1O54962 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Banf1O54962 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Banf1O54962 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Banf1O54962 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Banf1O54962 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Banf1O54962 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Banf1O54962 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Banf1O54962 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Banf1O54962 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Banf1O54962 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Banf1O54962 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Banf1O54962 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Banf1O54962 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Banf1O54962 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Banf1O54962 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Banf1O54962 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Banf1O54962 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Banf1O54962 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Banf1O54962 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Banf1O54962 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Banf1O54962 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Banf1O54962 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Banf1O54962 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Banf1O54962 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Banf1O54962 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Banf1O54962 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Banf1O54962 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Banf1O54962 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Banf1O54962 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Banf1O54962 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Banf1O54962 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Banf1O54962 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Banf1O54962 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Banf1O54962 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Banf1O54962 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Banf1O54962 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Banf1O54962 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Banf1O54962 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Banf1O54962 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Banf1O54962 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Banf1O54962 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Banf1O54962 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Banf1O54962 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Banf1O54962 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Banf1O54962 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Banf1O54962 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms