Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pole2O54956 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pole2O54956 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Pole2O54956 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pole2O54956 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pole2O54956 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pole2O54956 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pole2O54956 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pole2O54956 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pole2O54956 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pole2O54956 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pole2O54956 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pole2O54956 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pole2O54956 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pole2O54956 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pole2O54956 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Pole2O54956 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pole2O54956 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pole2O54956 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pole2O54956 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pole2O54956 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pole2O54956 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pole2O54956 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pole2O54956 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pole2O54956 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pole2O54956 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pole2O54956 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pole2O54956 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pole2O54956 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pole2O54956 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pole2O54956 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pole2O54956 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pole2O54956 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pole2O54956 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pole2O54956 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pole2O54956 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pole2O54956 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pole2O54956 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pole2O54956 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pole2O54956 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pole2O54956 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pole2O54956 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pole2O54956 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pole2O54956 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pole2O54956 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pole2O54956 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pole2O54956 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pole2O54956 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pole2O54956 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pole2O54956 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pole2O54956 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pole2O54956 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pole2O54956 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pole2O54956 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pole2O54956 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pole2O54956 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pole2O54956 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pole2O54956 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pole2O54956 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pole2O54956 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pole2O54956 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pole2O54956 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pole2O54956 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pole2O54956 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pole2O54956 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pole2O54956 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pole2O54956 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pole2O54956 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pole2O54956 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pole2O54956 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pole2O54956 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pole2O54956 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pole2O54956 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pole2O54956 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pole2O54956 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pole2O54956 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pole2O54956 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pole2O54956 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pole2O54956 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pole2O54956 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pole2O54956 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pole2O54956 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pole2O54956 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pole2O54956 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pole2O54956 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pole2O54956 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pole2O54956 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pole2O54956 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pole2O54956 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pole2O54956 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Pole2O54956 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pole2O54956 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pole2O54956 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pole2O54956 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pole2O54956 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pole2O54956 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pole2O54956 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pole2O54956 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pole2O54956 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Pole2O54956 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.8 ms