Protein–RNA interactions for Protein: O54834

Arhgap6, Rho GTPase-activating protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap6O54834 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28,32■■■□□ 2,12
Arhgap6O54834 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Arhgap6O54834 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Arhgap6O54834 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Arhgap6O54834 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Arhgap6O54834 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Arhgap6O54834 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Arhgap6O54834 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Arhgap6O54834 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,28■■■□□ 2,12
Arhgap6O54834 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Arhgap6O54834 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,26■■■□□ 2,11
Arhgap6O54834 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Arhgap6O54834 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Arhgap6O54834 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28,24■■■□□ 2,11
Arhgap6O54834 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Arhgap6O54834 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Arhgap6O54834 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Arhgap6O54834 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Arhgap6O54834 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28,21■■■□□ 2,11
Arhgap6O54834 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28,21■■■□□ 2,11
Arhgap6O54834 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Arhgap6O54834 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28,19■■■□□ 2,1
Arhgap6O54834 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Arhgap6O54834 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Arhgap6O54834 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Arhgap6O54834 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28,16■■■□□ 2,1
Arhgap6O54834 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Arhgap6O54834 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28,15■■■□□ 2,1
Arhgap6O54834 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Arhgap6O54834 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,14■■■□□ 2,09
Arhgap6O54834 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,09
Arhgap6O54834 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28,13■■■□□ 2,09
Arhgap6O54834 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28,13■■■□□ 2,09
Arhgap6O54834 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Arhgap6O54834 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28,12■■■□□ 2,09
Arhgap6O54834 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28,11■■■□□ 2,09
Arhgap6O54834 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Arhgap6O54834 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Arhgap6O54834 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Arhgap6O54834 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Arhgap6O54834 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28,07■■■□□ 2,08
Arhgap6O54834 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Arhgap6O54834 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Arhgap6O54834 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Arhgap6O54834 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Arhgap6O54834 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Arhgap6O54834 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28,04■■■□□ 2,08
Arhgap6O54834 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Arhgap6O54834 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Arhgap6O54834 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Arhgap6O54834 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28,03■■■□□ 2,08
Arhgap6O54834 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28,02■■■□□ 2,08
Arhgap6O54834 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2,07
Arhgap6O54834 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Arhgap6O54834 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Arhgap6O54834 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Arhgap6O54834 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27,96■■■□□ 2,07
Arhgap6O54834 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Arhgap6O54834 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Arhgap6O54834 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Arhgap6O54834 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,91■■■□□ 2,06
Arhgap6O54834 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Arhgap6O54834 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,9■■■□□ 2,06
Arhgap6O54834 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,06
Arhgap6O54834 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,05
Arhgap6O54834 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Arhgap6O54834 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Arhgap6O54834 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Arhgap6O54834 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Arhgap6O54834 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Arhgap6O54834 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27,86■■■□□ 2,05
Arhgap6O54834 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Arhgap6O54834 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27,85■■■□□ 2,05
Arhgap6O54834 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Arhgap6O54834 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,82■■■□□ 2,04
Arhgap6O54834 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Arhgap6O54834 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27,82■■■□□ 2,04
Arhgap6O54834 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Arhgap6O54834 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Arhgap6O54834 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Arhgap6O54834 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Arhgap6O54834 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Arhgap6O54834 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Arhgap6O54834 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Arhgap6O54834 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Arhgap6O54834 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,76■■■□□ 2,04
Arhgap6O54834 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Arhgap6O54834 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Arhgap6O54834 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Arhgap6O54834 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27,74■■■□□ 2,03
Arhgap6O54834 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Arhgap6O54834 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Arhgap6O54834 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
Arhgap6O54834 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
Arhgap6O54834 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27,7■■■□□ 2,02
Arhgap6O54834 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Arhgap6O54834 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,69■■■□□ 2,02
Arhgap6O54834 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27,69■■■□□ 2,02
Arhgap6O54834 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,68■■■□□ 2,02
Arhgap6O54834 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30,2 ms