Protein–RNA interactions for Protein: O54785

Limk2, LIM domain kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk2O54785 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Limk2O54785 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Limk2O54785 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Limk2O54785 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Limk2O54785 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Limk2O54785 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Limk2O54785 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Limk2O54785 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Limk2O54785 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Limk2O54785 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Limk2O54785 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Limk2O54785 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Limk2O54785 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Limk2O54785 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Limk2O54785 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Limk2O54785 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Limk2O54785 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Limk2O54785 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Limk2O54785 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Limk2O54785 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Limk2O54785 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Limk2O54785 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Limk2O54785 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Limk2O54785 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Limk2O54785 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Limk2O54785 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Limk2O54785 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Limk2O54785 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Limk2O54785 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Limk2O54785 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Limk2O54785 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Limk2O54785 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Limk2O54785 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Limk2O54785 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Limk2O54785 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Limk2O54785 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Limk2O54785 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Limk2O54785 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Limk2O54785 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Limk2O54785 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Limk2O54785 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Limk2O54785 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Limk2O54785 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Limk2O54785 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Limk2O54785 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Limk2O54785 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Limk2O54785 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Limk2O54785 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Limk2O54785 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Limk2O54785 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Limk2O54785 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Limk2O54785 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Limk2O54785 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Limk2O54785 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Limk2O54785 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Limk2O54785 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Limk2O54785 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Limk2O54785 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Limk2O54785 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Limk2O54785 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Limk2O54785 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Limk2O54785 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Limk2O54785 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Limk2O54785 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Limk2O54785 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Limk2O54785 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Limk2O54785 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Limk2O54785 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Limk2O54785 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Limk2O54785 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Limk2O54785 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Limk2O54785 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Limk2O54785 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Limk2O54785 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Limk2O54785 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Limk2O54785 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Limk2O54785 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Limk2O54785 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Limk2O54785 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Limk2O54785 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Limk2O54785 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Limk2O54785 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Limk2O54785 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Limk2O54785 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Limk2O54785 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Limk2O54785 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Limk2O54785 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Limk2O54785 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Limk2O54785 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Limk2O54785 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Limk2O54785 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Limk2O54785 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Limk2O54785 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Limk2O54785 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Limk2O54785 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Limk2O54785 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Limk2O54785 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Limk2O54785 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Limk2O54785 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Limk2O54785 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110 ms