Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,66■■□□□ 1,7
Bnc1O35914 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,65■■□□□ 1,7
Bnc1O35914 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Bnc1O35914 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Bnc1O35914 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25,63■■□□□ 1,69
Bnc1O35914 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Bnc1O35914 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25,62■■□□□ 1,69
Bnc1O35914 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Bnc1O35914 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25,61■■□□□ 1,69
Bnc1O35914 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Bnc1O35914 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25,6■■□□□ 1,69
Bnc1O35914 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Bnc1O35914 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,57■■□□□ 1,68
Bnc1O35914 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25,56■■□□□ 1,68
Bnc1O35914 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Bnc1O35914 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Bnc1O35914 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25,52■■□□□ 1,68
Bnc1O35914 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Bnc1O35914 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Bnc1O35914 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Bnc1O35914 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Bnc1O35914 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Bnc1O35914 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25,46■■□□□ 1,67
Bnc1O35914 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,46■■□□□ 1,67
Bnc1O35914 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Bnc1O35914 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Bnc1O35914 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Bnc1O35914 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Bnc1O35914 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25,43■■□□□ 1,66
Bnc1O35914 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Bnc1O35914 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25,42■■□□□ 1,66
Bnc1O35914 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Bnc1O35914 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Bnc1O35914 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Bnc1O35914 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Bnc1O35914 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25,4■■□□□ 1,66
Bnc1O35914 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,4■■□□□ 1,66
Bnc1O35914 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Bnc1O35914 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Bnc1O35914 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,37■■□□□ 1,65
Bnc1O35914 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25,36■■□□□ 1,65
Bnc1O35914 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Bnc1O35914 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25,36■■□□□ 1,65
Bnc1O35914 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25,35■■□□□ 1,65
Bnc1O35914 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25,34■■□□□ 1,65
Bnc1O35914 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,64
Bnc1O35914 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Bnc1O35914 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,32■■□□□ 1,64
Bnc1O35914 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Bnc1O35914 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Bnc1O35914 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Bnc1O35914 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Bnc1O35914 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,29■■□□□ 1,64
Bnc1O35914 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25,29■■□□□ 1,64
Bnc1O35914 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25,27■■□□□ 1,64
Bnc1O35914 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Bnc1O35914 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25,24■■□□□ 1,63
Bnc1O35914 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Bnc1O35914 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Bnc1O35914 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Bnc1O35914 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Bnc1O35914 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Bnc1O35914 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25,21■■□□□ 1,63
Bnc1O35914 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25,2■■□□□ 1,63
Bnc1O35914 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25,2■■□□□ 1,62
Bnc1O35914 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25,2■■□□□ 1,62
Bnc1O35914 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25,19■■□□□ 1,62
Bnc1O35914 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25,19■■□□□ 1,62
Bnc1O35914 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25,17■■□□□ 1,62
Bnc1O35914 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,17■■□□□ 1,62
Bnc1O35914 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Bnc1O35914 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Bnc1O35914 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25,14■■□□□ 1,62
Bnc1O35914 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25,13■■□□□ 1,61
Bnc1O35914 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Bnc1O35914 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Bnc1O35914 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25,13■■□□□ 1,61
Bnc1O35914 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Bnc1O35914 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Bnc1O35914 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Bnc1O35914 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,1■■□□□ 1,61
Bnc1O35914 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25,1■■□□□ 1,61
Bnc1O35914 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Bnc1O35914 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Bnc1O35914 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Bnc1O35914 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,6
Bnc1O35914 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,6
Bnc1O35914 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Bnc1O35914 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Bnc1O35914 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Bnc1O35914 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Bnc1O35914 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Bnc1O35914 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Bnc1O35914 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25,01■■□□□ 1,59
Bnc1O35914 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
Bnc1O35914 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Bnc1O35914 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1,59
Bnc1O35914 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24,98■■□□□ 1,59
Bnc1O35914 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Bnc1O35914 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,97■■□□□ 1,59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17,6 ms